Basic Information

Symbol
GRIN3A
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Ionotropic Receptor NMDA Type Subunit 3A GluN3A Glutamate Receptor, Ionotropic, N-Methyl-D-Aspartate 3A N-Methyl-D-Aspartate Receptor Subtype 3A Glutamate Receptor Ionotropic, NMDA 3A NMDAR-L NMDAR3A NR3A Glutamate [NMDA] Receptor Subunit 3A KIAA1973
Location (GRCh38)
9:101569352-101738647
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_133445.3
Sequence length
7838.0 nt
GC content
0.4907

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2615.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2756.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1897.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_133445.3 NCBI
AGUCGCGUUGCUCCUCCGAGGAAGCAAGCGGCGGUGGCGACUCGGUGGA… 7838 nt 0.4907
Summary

This gene encodes a subunit of the N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptors, which belong to the superfamily of glutamate-regulated ion channels, and function in physiological and pathological processes in the central nervous system. This subunit shows greater than 90% identity to the corresponding subunit in rat. Studies in the knockout mouse deficient in this subunit suggest that this gene may be involved in the development of synaptic elements by modulating NMDA receptor activity. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GRIN3A was identified as a differentially wired gene in the prefrontal cortex associated with cell communication [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155]. In cynomolgus monkeys, chronic methamphetamine and heroin exposure downregulated the GRIN3A in the hippocampus, while cocaine exposure upregulated it, with these changes in mRNA expression validated by RT-qPCR [Choi et al. DOI:10.30773/pi.2022.0004].