Basic Information

Symbol
GRIN3B
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Ionotropic Receptor NMDA Type Subunit 3B GluN3B Glutamate Receptor, Ionotropic, N-Methyl-D-Aspartate 3B N-Methyl-D-Aspartate Receptor Subtype 3B Glutamate Receptor Ionotropic, NMDA 3B NMDAR3B NR3B NMDA Type Glutamate Receptor Subunit NR3B Glutamate [NMDA] Receptor Subunit 3B NMDA Receptor Subunit 3B
Location (GRCh38)
19:1000419-1009732
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138690.3
Sequence length
3281.0 nt
GC content
0.7025

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1644.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1692.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1196.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((((((.....)))).)))).)))(((((((((((.(((((((.((.(((((((((((((((((.(((((((((((.(((...(((.(((((((..(.((((.(((..((((((.....(((((((((.((((((.(((...(((((((((.((((.((..(((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.(((((((((((.(((.......)))..)).))))))))).)))))....((..(((....)))...))......)))))))).)))))).)).)))))....))))))))..))((((((.((......((.(((...))))).((((((((.(((.((((((((((.(((((...((((..((((((((.(((((....(((((((((.((((((((((((..((((....)))).......((((.(((((((....((((((((...(((((..((.(((.(((..(.((.((.(((.(((((((....)))..(((((((.(((((.((((.((..((((((((...........((((((((((((((((.....((.....))((((.(((.((.((((((((((((((...))))..(.((((((((.((((((.((((((...(((((((...(((...(((((.((((...)))).)))))((((...))))))).)))))))(((((......))))))).)))).)))))))))))))).)..(((.(((((.......))))).)))..))))).)))))...))...)))))))..((((((((.....))))))))))))))).))))))))).((((.((..(((.((((..(((.((((.(.((((((((..(((......)))....))))))))).))))..)))..)))).)))...)).)))).(((((..(((((.(((...(.(((((((..((((((....))))))..))))))).).))).....)))))))))).))))))))..)).))))...))))).))))))).((((((((...)))))))).....(((((.(((((.(((.(.((.(((((.(((((....))))).))(((..(((((((.((((((((....))))...)))))).))))))))(((((((......))))))).))).))).)))))))).)))))..)))).))))).))).)))))).))..))))).))))))))))))))).)))).(((((...(((.....)))...)))))(((((((..((.....))..)))))))((((....(((((.(((((((((........)))))..(((.((((((......((((.....))))((((((((((((...))).))))))(((((((((.((((..(((.((((.((((..............))))((((((.(((((((((......))))))(((..((((((...((((((((((.((.......)).))))).)))))..((((((((....(((((((((((...((....)))))))))))))....))))))))..)))))).))).......))).)))))).(((((((((((...................))))))).)))))))).))).)))))))))))))....)))(((.((((((((((((.....((((.((((((.((((.....(((((((((.(((..((.(((((((((.(((..((.(((..(((((((((((.(((.((((((((((......(((.....)))(((..((.((....)).))..)))..............(((........))).))))))))))........(((((...)))))(((.((((.(((((.(.(...((.((((.....)))).))...).))))))..)))))))...(((((......)))))....((((((...)))))).))))))))).)))))..)).)...))..))).)).))))).)))).)))))).)))))).....)))).))))))...))))...))))))).))))).)))....)))))).)))...........)))).)))))....))))(((....))))))))....)))))))..)).))))...((((((((..(((..((.(((((((....(((..................)))....))))))).))((((....))))..)))))))))))...)))....))))).))))))..(((((((.......)))))))..))..)))).))))))))).....((((((...((((..((((.(((.(((((((.(((((............(((.(((((....((..((((.....))))..)).))))).)))..)))))..(((((((((((......))))))))).)).))))))).(((.((.(((((...(((((((.(((...(((((...((((.((((((((...((((((..((.((((.(((.(((((((...........)))).)))))).))...)).))..)))))))))))....(((((((.....)))))))........))).))))....)))))...)))..))))))))))))..))))))))))).)..))))...))))))...)))))).))).)))))))).)))))))).((..(((.((((.((((.(.(((.(...).))).).)))))))))))....))....((((((.((((((.(((((.((((......)))).)))))...)))))).)))))).))))))))).)))).))).))))))))))...))).))))))))..))))))).)..))))))).)))....)))))))))))..(((...((((((((((((((((.(((((((((((..(((..(((.(((...))))))..)))..)))))))))))..))))))))))...)))))).)))...))).))..).)))))))))))))).)).)))))))..)))((((((((.(..((((............))))..)))))).)))........(((....)))(((((.....)))))..........))))))))((.((((.((((((....))))))(((((((((.((((((......))))))..(((........))).)))))))))..)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....(((((((((((.....))))}}})).)))(((((((((((.(((((((.((.(((((((((((((({({.(((((((((((.(((...(((.(((((((..{.(((({(((.,((((((,{{(.((((.,((({({,,,,.{||}}.((((((((({(((({(((((,((((((({((({{,,{|||.|||||{||...|||||.((((({(((((,((,.,..,{,,||{.||,|||||||||,||||}....||,.(((,...}||..|||.,....)))|||||.}})))),||,}}}||,,,,|||}}}|(((({,,.||,||||,{.||,|}||||||||{|||{|{{,{{|||||{{{.....{{(({{,{||,,||{{|...,,{{{||,|.,{{||{,},,))))),}),))))),),..}}))),))))))...}}}..,,,..|||}}}}))),})))|||||||,{{||||,{({(({{((.,{(({{({{(((((((((((((((,,.,||}|{{((((((({{(({{,((,.{,{{((({{,,.|{{{{{,(((((((((((((((({....||....,}}(((({((({(({({{{{{((({((({,,,||||..,.((((((((.((((((.((((((,(.((({(((,.(((({(((((((.(((|,,.)))){|||||((((...}})),,,.})))}))|||||}....}})}),)).)))).))))))))))))))|}{{{(({((({{..|,|,|||}}||||||,|||}|||||}}...)),..)))||||..((((((((.....))))))))||}}}}||}}}|}}})),||||}|||.(((.((((..(((.((((.(.((((((((..(((,.....)))....))))))))).))))..)))..)))).))),{((({{{(({(((((((((,.({(((((({.(((((((..((((((....))))))..)))))))((((.,....))))((((.....(((((((...,.(((,{(((.({.{.{((((((((((((((,..}})})}||{{{..(((((.(((((.(((.{.((.(((((.(((((....))))).)){{{,,(((((((.(((({(((....))))...)))))).)))))))|(((((((......))))))))))).))}.)))))))).))))),}}))){|{,,,}},,....,,,((((((,,((({((((,{{{(({((((,,....)))}.|||||,{{{(,.....))))|(((((((..((.....))..))))))},{{{||||,|}})))}))}.))).)))))..)))))}..,,....}))}.))))))}.),)))))).)))(((((((((...))).)))))).})|||}}..}|||....((((({.((((..............)))).}))))),}),)})))}...)}...))).))})).)))))}))),||||||{.||},,.,,,))}))))).|||||.{(((((,{{{.,|((((,((|(((,|.||..}}))))))))})|}}|,..|}||||}}.,},}}...,||.....,,}}))),||...(((((((((((...................))))))),))))||{{{{{{{|||.||||.||,,...)))))))}|},}}.))))))..,||||||||},..,,.,)),)))})})))))))}))}}}}))))}}}}}|},|,|.}}}||,|||,|||,..,|||..{|.(((((((.(((.....))).,.))))))),))||}}}...,|||||,|||||,,{{{{{,,{{{.{|{{{{......,(,{{,..||,,.........|.{((,{(({,{{((({,.{{.(({{..(,({{{,,.)))}},,..)}}}..,..(({({(((({.....{{{(({((((,{{{{((,((({{...((((({...}))))){(,{{,.((((,,,,....}}}},,,,,|}|||}}..((((.,,...,,))))..{((((.(({((((((((.(((({{(((({(({{{..|{{|||||,|.{{.|{||,|.|||||.......|,,}.|}}}}}}}|,}}}},,||{,..|,||||((((|.|.|,|||},..,,,))).,.|{|||||||,.|||..{{.(((((((....(((.{,.....,,........)))....))))))).}}|{{,....}|||,,|.,|)}}}})},{{(({..,|||{..{|}||||,.{(({{{{|,....,))))))).,(((..{{{.,,,.,}},(((((((..({.............)}.))))))).,|||{{{,.....,,,...,|||,,{,{{,,..,(,.((,({,..{||||{.,..||||,{|||..,,)))..(((((((((((......))))))))).)).,,,,},)}}}}|||}||||}.}||}..|,||(((({({.(((({.((({.{((((,(.{{{|,||||||,,,,|||}))))}}.}}}}}.....,)))})))||,||.}}|}.|||,}..})}})))})},}))))}.(((((((.....))))))).....,,..,|}}|{{,|,,},})),),,.,,.)))))))}),.)))))})))))}.)))))))))))}.))),..))),))))).))))).}))))).)))))}).,)))....,)}),))))})))))))}.,))))))}))})))||},}},..}})|}|,((((((.((((((.(((((.((((......)))).)))))...)))))).)))))).|}||},|}}|}))}.}},,}})))))))),},})),),)))))}.,))))))),),.))))))).)))....)))))))))))..((({{{{{({((((((((((((.(((((((((((..(((,.(((.(((...))))))..)))..)))))))))))..)))))))))).},)}})))}))}...))).,,,,).)))))))))))))).)).)))))))..)))((((((((.(..((((............))))..)))))).)))........(((....)))(((((.....)))))..........)))))))){(.((((,{(((((....))))}|(((((((((.((((({......})))))..,,,........))),)))))))))},)))))}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_138690.3 NCBI
CGACGCCGACAACUUUGCGAUGGAGUUUGUGCGGGCGCUGUGGCUGGGC… 3281 nt 0.7025
Summary

The protein encoded by this gene is a subunit of an N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptor. The encoded protein is found primarily in motor neurons, where it forms a heterotetramer with GRIN1 to create an excitatory glycine receptor. Variations in this gene have been proposed to be linked to schizophrenia. [provided by RefSeq, Nov 2015]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the GRIN3B was included in analyses of postmortem hippocampus from alcoholics, cocaine addicts, and controls, with no significant expression change found between groups [Enoch et al. DOI:10.1111/Gbb.12179].