Basic Information

Symbol
GRIP1
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Receptor Interacting Protein 1 Glutamate Receptor-Interacting Protein 1 FRASRS3 GRIP-1 GRIP
Location (GRCh38)
12:66347431-67069162
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Sudden unexpected death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001366722.1
Sequence length
5147.0 nt
GC content
0.4439

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1495.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1594.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1428.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001178074.2 NCBI
AGAUGACAUGUAGCGGACCUCUGCAUCAGCCAAGAGGAAUUAAGCUUUG… 4946 nt 0.4408
NM_001366722.1 NCBI
AGAUGACAUGUAGCGGACCUCUGCAUCAGCCAAGAGGAAUUAAGCUUUG… 5147 nt 0.4439
NM_001366723.1 NCBI
AUUCAUGCUCCACCGGCUCGCAGAGCAGCUGGGCUGUUGCUGUGCUCUU… 4978 nt 0.4421
NM_001366724.1 NCBI
AUUCAUGCUCCACCGGCUCGCAGAGCAGCUGGGCUGUUGCUGUGCUCUU… 4981 nt 0.4423
NM_001379345.1 NCBI
AUUCAUGCUCCACCGGCUCGCAGAGCAGCUGGGCUGUUGCUGUGCUCUU… 5137 nt 0.4452
NM_001379346.1 NCBI
AGAUGACAUGUAGCGGACCUCUGCAUCAGCCAAGAGGAAUUAAGCUUUG… 5102 nt 0.4437
NM_001379347.1 NCBI
AUUCAUGCUCCACCGGCUCGCAGAGCAGCUGGGCUGUUGCUGUGCUCUU… 4936 nt 0.4421
NM_001379348.1 NCBI
AUUCAUGCUCCACCGGCUCGCAGAGCAGCUGGGCUGUUGCUGUGCUCUU… 4933 nt 0.4419
NM_001379349.1 NCBI
GGCCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGAGCCGCCGGCGAGUUU… 5053 nt 0.4562
NM_001379351.1 NCBI
GGCCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGAGCCGCCGGCGAGUUU… 5005 nt 0.4559
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

This gene encodes a member of the glutamate receptor interacting protein family. The encoded scaffold protein binds to and mediates the trafficking and membrane organization of a number of transmembrane proteins. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, May 2010]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the mRNA biomarker Grip1 (Glutamate receptor interacting protein 1) was significantly upregulated in the hippocampus following cardiac arrest and cardiopulmonary resuscitation (CA/CPR) and was validated as a direct target of miR-155-5p within a critical MSTRG.13,871-miR-155-5p-Grip1 regulatory axis involved in post-cardiac arrest brain injury [Li et al. DOI:10.1038/s41598-024-75875-3].