Basic Information

Symbol
GRIP1
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Receptor Interacting Protein 1 Glutamate Receptor-Interacting Protein 1 FRASRS3 GRIP-1 GRIP
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Sudden unexpected death diagnosis

MANE select

Transcript ID
NM_001366722.1
Sequence length
5147.0 nt
GC content
0.4439

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1495.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1594.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1428.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((...(((...(((((((....))..)))))......))).))))).))(((...)))(((..((((((..((((((((((.(((((..(((...(((((((((....)))))......)))))))..))))).)))))...))))).)))))).)))((((((((..((((((((((..((((((.(((..(((((......(((((.(((((.(.......).)))))))).)).....(((.((((((((.(...((..((....)).)))))))))).).)))))))).)))(((....))).((((..(((((.((....)).)))))..))))....((((((.......(((((((((.(((...(((((((.....(((((.((((..((((.((((......((((((((((.......))))))).))).((((((.(((((((((((....)))))))..((((((..((((..((..(.((((........)))).)..))..))))..)).))))........(((((((((.(.(((((((((..((((((..((.(......)))..)))))).)))))))))..).)).)))))))..))))...))))))((((((....(((((.....))))).....))))))((.((((.(((((((((..((((((......))).)))((....))....))))))))).)))).))..((((.((.....)).))))............(((..((((..(((.(((.........))).)))..))))..))).((.((((((..(((((((((.(((((...((...))...))))).((..((((..((((........)))).))))..)).)))).)))))..)))))).))(((.(((.(.....).))).)))...)))).)))))))).)))))(((((((............(((.((((((.((((........)))).)))).))..)))...(((((((((..(((((((..((((((..(((((.(((.(((((........)))))))))))))...))).)))...)).))))).))))))))).)))))))(((((((((.((.......)).)))))...)))).....)))))))..))).)))))))))((((((((...(((((((((.((.(.(((....))).))).((.....))........)))).)))))))))))))..........))))))(((...(((((((((.......((((((((((..((((((..((((.(((((((.((((((.(((..(((((..((((..(((((((....((((((((.(((((..(..(((((((((.((((((((((.((.....))))((((((((.......)))))))).................(((((........)))))..))))..))))))))))..)))..)..))))).)).))))))...(((((..(((((((.........)))..))))))))))))))))...............))))..)))))..)))(((((((((...))))))))).......(((((((((((...(((((((((.......((.((((((((((..((((...(((((((((...((((......)))).....))))))))).....)))).)))))).)))).))..(((((...(((....((((.((((((......((((...(((((((((...(((((((((((((((..........((((.((((.(((.(....).))).)))).)))))))))))(((.(((......((((((((...(((((...(((........)))...)))))((((((((.....)))..)))))....((((((......(((((.(.(((.(((.((.((((.........)))))))))((((...)))).....))).)))))).......(((((..(((.((......)))))))))).))))))....))))))))))).)))(((((((((((((((((((....(((.((((((((((.(((............((((((..(((..(((((((.((.....((((((.(((............((((((.(......).))))))((.(((....))).)).....))).)))))).....)))))))))...)))..))))))..))).))))))..((((.....(((((.....((((.(((.(((.....)))...(...((((.((((((..((((((..((((...((((....)))).....)))).......))))))..))))))))))..).(((((..(((((...))))).....))))).))))))))))))......)))).(((((((((((..((((.(((..((((((.....((((.(((((..(((((.(((((.....((......)).)))..)).)))))..))))).))))(((((((((((((...)))...))))))))))(((((((..((((((((...))))).))).)))))))))))))))).((((((((((...(((((((.......))....(((((..((((..(((((.........(((((....((........))....))))).......)))))..))))..))))).)))))...))))))))))...(((....(((((..((......))..))))))))...((......))))))....))).)))))))))))))))...)))))))))))))))...))))(..(..((((.....))))..)..)))))))))..(((((((..(((.((((....((((........))))((((((.......))))))(((((...((((.......))))...))))).))))..))).)))))))(((....(((((((((((((.(((..(((((((.(((.(((.(.....).))).......(((((.((....(((((((........)))))))...((((.....))))......................((((((...))))))..(.((((((((((((.((((((...)))))).))......(((.(((((.((.((((((((((((((.(((.....)))))))))......((((((.........))))))((((....))))((((....))))...))))))))))))))).))))))).)))))).).....)))))))...........)))))))))).((((((((.....))))))))..))).)))...)))))).))))..............))))))))))))...))))(((.((((((....).)))))...)))....((((((((((.....((((((.......((((....((((((((((...((((......))))...)))).................(((((....)))))((((....((.((.(((....))).)))).....))))....((((((((((..........)))))).))))......)))))).....))))))))))..(((((.................))))).))))))))))((((((((...))))))))..))))))))))...)))..)))))...))))))))).))))))).))))(((...(((((((.......(((((......................((.(((((((.((((((.(((.(((..((((..((........))..))))..)))...)))..)))))).))))))))).(((((((.............)))))))..(((((((...............)))))))..))))).....(((((..........)))))..)))))))..)))....)))))).))......))))).))).)..))))))..)))))...)))))........(((.(((((...(((.(((....))).)))..)))))))).......)))))))))...)))...((((..(((((((((((......((......))....)))).)))))))..((((((((((..(((((((((((..(((.(((............))).)))(((((((.....)))))))(((((((.....)))))))...((((((....((((..............(((((.((((.......)))).))))).(((((.....))))).((((((((...((((......)))).))))))))........))))))))))..))))))))))).....))))))).))).))))(((((.....)))))))))))..)))...)).)))))))))))))...(((((((........((((.(((....))).))))(((((....(((((.....................)))))...)))))(((((((((.(((....)))..)))))))))......(((((((((...)))))))))...((((((.............))))))...........(((((((((..((((((((...(((.(((((.....(((((((((((((((..(((((.........)))))..)))).............(((((((((((.((.((.....)).)).)))))))))))....((((((((.(((......))).))))))))..........))))))))))).((.((((....((....))....))))))....((((......)))).......................))))))))..))))))))..))))))))).......((((((((((.(((((((....))).))))..)))))))))).....)))))))...((((.(((.(((.(((((((...(((.(((...((((((...((((((..((((..............)))).))))))))))))....))).)))..))))))).))).))).)))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{({,(((((.({,,.(((((((....}}..}))))......((((((({..((((....)))|.{{{(,.,,,..,||||(((((.(((((..(((...(((((((((....)))))......))))}}),.))))).)))))..,{(((((.,......))).)))||{,{((((((.((,..........}}.))))))}..}}}|{(((.(((((.(.......).)))))))).,......(((.((((((({.,...,({,{{....)).}})))))))).).))))))))})).{{(....))}.{(((..(((((.((....)).)))))..)))}...,((((((......,{((((((((.(((...(((((({.,,..{((((.((((,.{(((.((((......((((((((((.......))))))).))).((((((.(((((((((((....)))))))..((((((..((((..((..(.((((........)))).)..))..))))..))}})))........{{((((({{.,.(((((((((..,(((((..((.{......}))..))))}}.)))))))))..}.}}.)))))),..))))...)))))){(((((.,,.(((((.....)))))..,..)))))}((.((((.(((((((((,{{({{{,......}}},}}}....,,},,,..))))))))).)))).)),,((((.((.....)).))}).|.....,,((,(.{,,|,||}}|,}},,}},||.{((,,(((((((..,(((..,..((.((((((..(((((((((.{((({...(,...}}...))))}.((..({((,,(({(........)))).))))..)).)))).)))))..)))))).)),,}}},....)))))}),,.,)),..)))).)))))))).))))}(((((((...........,((({{(((((.{{{{....,.,,)))}.}))).}}..,,,...(((((((((..(((((((..((((((..(((((.(((.(((((........)))))))))))))...))},)))...)).))))).))))))))).))))))),{{,(((((.((.......)).)))))...,}}},,},.))))))),.))).))))))))}((((((((...{((({{(({.{{.{.(((....})),|||.((..,.,|}..,,,...}))).))))))))))))).......,..)))))).,....,(((((({{.......(((({{({((,.{{{{{(,,|{{|.{{{((((,(,{{,,.(((..(((((..((((..,{{{(((....((((((((.(((((..{..(((((((((.((((((((((.((....,|...((((((((.......))))))))...,,....}},}}...(((((........)))))..})))..))))))))))..)))..,,.))))).}))))))))...(((((..(((((((.{{...|}.)))..))))))))))))))}|......,........))))..)))))..)))(((((((((...))))))))),,......,||||||||{,{{{{,,{{{{{.,.....((.((((((((((..((((...(((((((((...((((......)))).....))))))))).....)))).)))))).)))),))}|||{,,,,.{||....)))...{{{(,,,,{{{||||.,.,..(((.(((((((((((({(((((((.,......,.((((.((((.(((.(....).))).)))).)))))))))))(((.(((......((((((((...,|{{{...(((........)))...|||}|((((((((.....}),.,))))).,,,|(({{{......(((((.(.(((,{({.{{.{{{{.........}},}}})}|{{{|...}}),...,,))).))))))..,,}}}((((,.,(((.({......))))}))))),)))}}},...))))))))))).)))(((((((((((((((((((....((,{((((((((((.(((............,(((((..(({..(((((((.((.....((((((,(({............((((((.(,.....},)))))){{,(((....))).,}.....})).)))))).....)))))))))...}})..))))))..))).))))))..{(((,.,..(((({....,((((.(((.(((.....)))...,...((((.((((((..((((((..((((.,.{(((...,))})...}.)})).......})))))..))))))))))..,.(((((..(((({...})))).....))))).))))))))))))......)))).(((((((((((..{(({.{{{,,{{{{(({,{{{(({{,.((((,,((({{.,|}}}}.,,.{|,,,...})|})),..}|})||}..}}||,,|}||{{{{{{{|{{{,..{|,||{{{||(((||{{|(((((((..((((((((...})))).))).))))))}.},},.||},||{|||{{||,|}{{{{(({.......}}....{|{{{|,{||{.||{||{}......,,|||||.}},||,}}}}}}})),,..|||||,,.,,,.|||||.{|||,..,)))),}))))},.}}}}))))))..}}}}}}}}}}}}},,))}}}}}}}}}}}}||||{....},}}}}.,.,}))}....))).)))))))))))))))...)))))))))))))))...)))){..(..((((,...,))))..)..)))))))}...,}))))).)))||||||||||{{{{,,...{,.(((((((((........|||,{{(((((...((((.......))))...)))))....}},,}|,,{(((((((({(((...({{((((((((((((.{,.,..||{,}}(({.{,....,.))}......{{{{|,||.,{..(((((((.,....,.)))))))..}|,,|,....))))}.....................((((((...))))))..)))))).)))))))}((((((...))))))....,....,(((((((.{,..((((...(((((((.(((.....)))))))))).,}})|,,).))))))}.......)))))))))))}))|}}}}}}|},|||,{((|...})))|||,||,.||{|{{{{{,|(({.,{(({({{{{,,,,||,|||.,}||,|,,|||||,}|{|{|||{{||||||{{{..(((((.......))))).}||||},,.{{{.,....,.}}}((((((...))))))..{{{(((,...}.|||}||||||{{{..(((((((((({{.,.((((((.......((((....((((((((((...((((......))))...))))..........,,,,...(((((....))))),{{{....{{,...,,||,....}})))),....}},,....((((((((((.,.......,)))))).))))......)))))).....)))))))))){{((((,......}}}))}.....},.)).))))))))))((((((({...})))))))..,,)))}})))))}|{{{{,||},.}}}|||||||,.,))))}))}|||{{{{.,{((((((.......((,,..,},......}}}},,......((.(((((((.((((((.(((.(((..((((..((........))..))))..)))...)))..)))))).))))))))).|((((({............,)))}}}|{,(((((((..{,,.....},...))))))),},|{{{,....{((({.,.,......}))))}}))}}|||||))},.,,))))}},)),....,)}))),))).|,,}}}))),,))))),,,))))}....,,||||,.|||||...{|{,|{{,,..))).})),,)))))}|||.,.,,.}))}|}|||{{,...|}|||||,,(((((((((((......{{......}}....))))}))))))).........,,,.{(((({,,..||}})}|,}|||||,,|||||||}|},|||}|.,,{{{{{{{||,....(((((((.....))))))).{{(({{(,.,.{((({,.,,{|,,.,,,,,||||||{|||,...,,{|||,.},,},.(((((.....))))).((((((((...((({{....})))}.))))))))........,,},,..,})}})},,||||||||....|||||||{||||||||{{{{{|..,,))),|,,,,..,,||,.|||,.,,,|||||||||||{.((.((({........((((.(((....))).}))},..,,.,)})),}}}},.,}}}}}}}....}}}}}))},,..,,||,((((((((((.{{{....})}..))))))))))...,.|((((((({...})))))))},},|||,,,,,...}}}}))).,,})))..}.,,,,,,,|.|||||}.,,||,,}|,|}||||||{..,,..,..,{(((((((((((((..(((((.........)))))..))))},,........,.(((((((((((.((.({.....}).)).))))))))))),...{({{{{{{.{{,......})}.}))))))}..........,,})))))}}}..,.,,|},,,.,,,,,,))))},}}|}|||||.,,}||,,||||{}|,,,...............,,}||}},}}.}}..,,,,}}}}}}}}}||||||.....},||((((({,.{(((({(({{{{.,,.,,,,.,,..)))))))},.}})}})))),,,{(((.(((.(((.(((((((..{(((,(({...((((((...((((((,,,((,............,,,,)).))))))))))))....)))})))..))))))).))).))).)))),}))}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGAUGACAUGUAGCGGACCUCUGCAUCAGCCAAGAGGAAUUAAGCUUUG… 4991 nt 0.4410
Showing 11 to 11 of 11 entries
Summary

This gene encodes a member of the glutamate receptor interacting protein family. The encoded scaffold protein binds to and mediates the trafficking and membrane organization of a number of transmembrane proteins. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, May 2010]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the mRNA biomarker Grip1 (Glutamate receptor interacting protein 1) was significantly upregulated in the hippocampus following cardiac arrest and cardiopulmonary resuscitation (CA/CPR) and was validated as a direct target of miR-155-5p within a critical MSTRG.13,871-miR-155-5p-Grip1 regulatory axis involved in post-cardiac arrest brain injury [Li et al. DOI:10.1038/s41598-024-75875-3].