Basic Information

Symbol
GRK4
RNA class
mRNA
Alias
G Protein-Coupled Receptor Kinase 4 GPRK4 GPRK2L EC 2.7.11.16 G Protein-Coupled Receptor Kinase 2-Like (Drosophila) G Protein-Coupled Receptor Kinase 2-Like G Protein-Coupled Receptor Kinase GRK4 EC 2.7.11 GRK4a IT11 ITI1
Location (GRCh38)
4:2963571-3040760
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_182982.3
Sequence length
2372.0 nt
GC content
0.5257

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-822.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -866.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 593.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001004056.2 NCBI
GUAGUGCCCCGGCCGCGGCGGCGAGGGGCGCUCCCUCUUCAGCUAAGCC… 2276 nt 0.5290
NM_001004057.2 NCBI
GUAGUGCCCCGGCCGCGGCGGCGAGGGGCGCUCCCUCUUCAGCUAAGCC… 2234 nt 0.5322
NM_001350173.2 NCBI
GUAGUGCCCCGGCCGCGGCGGCGAGGGGCGCUCCCUCUUCAGCUAAGCC… 2127 nt 0.5364
NM_005307.3 NCBI
GUAGUGCCCCGGCCGCGGCGGCGAGGGGCGCUCCCUCUUCAGCUAAGCC… 2138 nt 0.5360
NM_182982.3 NCBI
GUAGUGCCCCGGCCGCGGCGGCGAGGGGCGCUCCCUCUUCAGCUAAGCC… 2372 nt 0.5257
Summary

This gene encodes a member of the guanine nucleotide-binding protein (G protein)-coupled receptor kinase subfamily of the Ser/Thr protein kinase family. The protein phosphorylates the activated forms of G protein-coupled receptors thus initiating its deactivation. This gene has been linked to both genetic and acquired hypertension. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GRK4 transcript increased in abundance within 0.5 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267]. In a subsequent forensic validation study, the GRK4 was part of a seven-gene set from mouse brain that accurately predicted postmortem interval (PMI) using linear regression, yielding an R² of 0.95 and a slope of 0.87 between predicted and actual times [Hunter et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2017.02.027].