Basic Information

Symbol
GRM1
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Metabotropic Receptor 1 GPRC1A MGLUR1 PPP1R85 MGlu1 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 85 Glutamate Receptor, Metabotropic 1 Metabotropic Glutamate Receptor 1 SCAR13 MGluR1 SCA44
Location (GRCh38)
6:146027646-146437601
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001278064.2
Sequence length
6846.0 nt
GC content
0.4814

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2195.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2327.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1972.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001278064.2 NCBI
AAGCUGUUCCUGCAGCCGAUAUCAGGAUGUGCCGAAAUGAAACGGACAA… 6846 nt 0.4814
NM_001278065.2 NCBI
AGAGCUGAGGCGUCUGCAAGCCGAGCGUGGCCACGGUCCUCUGGCCCCG… 6917 nt 0.4853
NM_001278066.1 NCBI
CAUCUAGCUCACCGCUGCCAACACGACUUCCACUGUACUCUUGAUCAAU… 6757 nt 0.4835
NM_001278067.1 NCBI
CAUCUAGCUCACCGCUGCCAACACGACUUCCACUGUACUCUUGAUCAAU… 6672 nt 0.4826
Summary

This gene encodes a metabotropic glutamate receptor that functions by activating phospholipase C. L-glutamate is the major excitatory neurotransmitter in the central nervous system and activates both ionotropic and metabotropic glutamate receptors. Glutamatergic neurotransmission is involved in most aspects of normal brain function and can be perturbed in many neuropathologic conditions. The canonical alpha isoform of the encoded protein is a disulfide-linked homodimer whose activity is mediated by a G-protein-coupled phosphatidylinositol-calcium second messenger system. This gene may be associated with many disease states, including schizophrenia, bipolar disorder, depression, and breast cancer. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, May 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GRM1 was identified as a differentially wired gene in the prefrontal cortex, where it was enriched in synapse part annotations, suggesting a role in glutamate-mediated synaptic plasticity associated with selective breeding for high versus low methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].