Basic Information

Symbol
ABCC11
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily C Member 11 MRP8 ATP-Binding Cassette, Sub-Family C (CFTR/MRP), Member 11 ATP-Binding Cassette Sub-Family C Member 11 Multidrug Resistance-Associated Protein 8 ATP-Binding Cassette Transporter Sub-Family C Member 11 ATP-Binding Cassette Transporter MRP8 ATP-Binding Cassette Protein C11 Multi-Resistance Protein 8 EC 7.6.2.2 EC 7.6.2.3 EWWD WW
Location (GRCh38)
16:48165773-48247568
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001370497.1
Sequence length
5894.0 nt
GC content
0.5022

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2044.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2152.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1615.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001370496.1 NCBI
GCGGGGUCAGGCGUGUUGGGGAUGACGCCCAGGAUGGUGCUUUGCAGCG… 6054 nt 0.5130
NM_001370497.1 NCBI
GCACACUAACGUGCAGAAAGGGACUGUACUACUCAAAACCACCAAGGAA… 5894 nt 0.5022
NM_032583.4 NCBI
GCGGGGUCAGGCGUGUUGGGGAUGACGCCCAGGAUGGUGCUUUGCAGCG… 6094 nt 0.5120
NM_033151.4 NCBI
ACUGGGAUAAAGCAAGAAGACUGAUUUUAUGAGCAGGGGUUUGAUACAU… 6000 nt 0.5020
NM_145186.3 NCBI
GCGGGGUCAGGCGUGUUGGGGAUGACGCCCAGGAUGGUGCUUUGCAGCG… 5980 nt 0.5117
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This ABC full transporter is a member of the MRP subfamily which is involved in multi-drug resistance. The product of this gene participates in physiological processes involving bile acids, conjugated steroids, and cyclic nucleotides. In addition, a SNP in this gene is responsible for determination of human earwax type. This gene and family member ABCC12 are determined to be derived by duplication and are both localized to chromosome 16q12.1. Multiple alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ABCC11 gene was significantly upregulated in the peripheral blood mononuclear cells of sepsis patients compared to healthy controls, with a log2 fold change of 5.16 [Wu et al. DOI:10.7150/ijms.46910]. A separate multi-omics study in humans and mice identified the ABCC11 protein as an early warning marker for severe burn-associated sepsis, showing statistically different levels between burn patients without and with sepsis on Burn-day 1, and further validation in a mouse model of severe burn injuries demonstrated that inhibition of the ABCC11 protein with paquinimod increased survival, inhibited neutrophil mobilization and activation, and ameliorated lung injury [Huang et al. DOI:10.1093/burnst/tkac050]. A study in rats demonstrated that the ABCC11 is mentioned in the literature as a calcium-binding protein that is time-dependently expressed in surgically treated human skin wounds, as referenced in the introduction and discussion of the research [Abd-Elhakim et al. DOI:10.1007/S00414-022-02788-Z].