Basic Information

Symbol
GRM4
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Metabotropic Receptor 4 GPRC1D MGLUR4 MGlu4 Glutamate Receptor, Metabotropic 4 Metabotropic Glutamate Receptor 4 MGluR4
Location (GRCh38)
6:34018643-34155622
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000841.4
Sequence length
7368.0 nt
GC content
0.5998

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3169.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3294.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1589.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000841.4 NCBI
GCUGUACUUUUCUGGGUGUGUGUUAGGGAGGCUAUGUUCCUGACCCUCC… 7368 nt 0.5998
NM_001256809.3 NCBI
AAUCCCAGCGCUUUGCUGGAGGAUCGCUUGAGCCCAGGAAUUCAAGACC… 6801 nt 0.5980
NM_001256811.3 NCBI
GCUGUACUUUUCUGGGUGUGUGUUAGGGAGGCUAUGUUCCUGACCCUCC… 7227 nt 0.5997
NM_001256812.2 NCBI
GAUGCCCUGGGGACUCACGGGCUGCAGGUGCUACCAGCCCAGCACCCCG… 6518 nt 0.5959
NM_001256813.3 NCBI
AGAGAUGCUGGAGCUGUGGACCUGGGCGGUCCUGGUGGAGGAGUGCCUG… 6711 nt 0.5962
NM_001282847.2 NCBI
GCUGUACUUUUCUGGGUGUGUGUUAGGGAGGCUAUGUUCCUGACCCUCC… 7151 nt 0.5992
Summary

L-glutamate is the major excitatory neurotransmitter in the central nervous system and activates both ionotropic and metabotropic glutamate receptors. Glutamatergic neurotransmission is involved in most aspects of normal brain function and can be perturbed in many neuropathologic conditions. The metabotropic glutamate receptors are a family of G protein-coupled receptors, that have been divided into 3 groups on the basis of sequence homology, putative signal transduction mechanisms, and pharmacologic properties. Group I includes GRM1 and GRM5 and these receptors have been shown to activate phospholipase C. Group II includes GRM2 and GRM3 while Group III includes GRM4, GRM6, GRM7 and GRM8. Group II and III receptors are linked to the inhibition of the cyclic AMP cascade but differ in their agonist selectivities. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2012]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the GRM4 was up-regulated in the hippocampus of alcoholics relative to controls and cocaine addicts [Enoch et al. DOI:10.1111/Gbb.12179]. In mice, the GRM4 was identified as part of a unique gene expression cluster in the nucleus of the solitary tract associated with stress-induced escalations in alcohol drinking in dependent animals [Grantham et al. DOI:10.1016/J.Neuropharm.2023.109768].