Basic Information

Symbol
GRM5
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Metabotropic Receptor 5 MGLUR5 GPRC1E PPP1R86 MGlu5 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 86 Glutamate Receptor, Metabotropic 5 Metabotropic Glutamate Receptor 5 MGluR5
Location (GRCh38)
11:88504576-89065982
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001143831.3
Sequence length
7996.0 nt
GC content
0.4493

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2432.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2582.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2602.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000842.5 NCBI
ACGCCGCCCUCAGCUCGGCUGUUCUGCGCACGCUGAGCGGAGGGAAUGA… 7872 nt 0.4455
NM_001143831.3 NCBI
GCGUCUGCCCGAGCGCGGCACGUGCUCCCGGCGCUGGCGCGAGAGAGCG… 7996 nt 0.4493
NM_001384268.1 NCBI
GCGUCUGCCCGAGCGCGGCACGUGCUCCCGGCGCUGGCGCGAGAGAGCG… 7900 nt 0.4485
Summary

This gene encodes a member of the G-protein coupled receptor 3 protein family. The encoded protein is a metabatropic glutamate receptor, whose signaling activates a phosphatidylinositol-calcium second messenger system. This protein may be involved in the regulation of neural network activity and synaptic plasticity. Glutamatergic neurotransmission is involved in most aspects of normal brain function and can be perturbed in many neuropathologic conditions. A pseudogene of this gene has been defined on chromosome 11. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GRM5 was identified as a differentially wired gene in the prefrontal cortex, enriched in synapse part annotations and part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes, indicating its role in the transcriptomic basis of risk for methamphetamine addiction in selectively bred lines [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155]. In a porcine model of cutaneous bromine injury, the GRM5 was significantly increased in all four experimental groups and was involved in Huntington’s disease, synaptic long-term potentiation, and axonal guidance signaling pathways, identifying it as a potential therapeutic target for chemical-induced skin injury [Price et al. DOI:10.1016/j.toxlet.2008.08.007].