Basic Information

Symbol
GRM7
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Metabotropic Receptor 7 GPRC1G MGLUR7 PPP1R87 GLUR7 MGlu7 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 87 Glutamate Receptor, Metabotropic 7 Metabotropic Glutamate Receptor 7 NEDSHBA MGluR7
Location (GRCh38)
3:6770001-7741533
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000844.4
Sequence length
4149.0 nt
GC content
0.4914

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1346.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1423.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1136.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000844.4 NCBI
AGUGCUGGGCUGUUGGAGAGAGCGAGCAGCAAGCCGGUGAGCGCGAGCG… 4149 nt 0.4914
NM_181874.3 NCBI
AGUGCUGGGCUGUUGGAGAGAGCGAGCAGCAAGCCGGUGAGCGCGAGCG… 4241 nt 0.4895
Summary

L-glutamate is the major excitatory neurotransmitter in the central nervous system, and it activates both ionotropic and metabotropic glutamate receptors. Glutamatergic neurotransmission is involved in most aspects of normal brain function and can be perturbed in many neuropathologic conditions. The metabotropic glutamate receptors are a family of G protein-coupled receptors that have been divided into three groups on the basis of sequence homology, putative signal transduction mechanisms, and pharmacologic properties. Group I includes GRM1 and GRM5, and these receptors have been shown to activate phospholipase C. Group II includes GRM2 and GRM3, while Group III includes GRM4, GRM6, GRM7 and GRM8. Group II and III receptors are linked to the inhibition of the cyclic AMP cascade but differ in their agonist selectivities. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2009]

Forensic Context

A study in zebrafish demonstrated that the GRM7 was part of an 11-gene transcript set used in a perfectly-defined linear regression model to predict postmortem interval, where this specific set yielded an R² of 1 and a slope of 0.99 between predicted and actual times [Hunter et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2017.02.027].