Basic Information
Symbol
GRN
RNA class
mRNA
Alias
Granulin Precursor
PCDGF
PGRN
Progranulin
CLN11
PC Cell-Derived Growth Factor
Glycoprotein Of 88 Kda
Glycoprotein 88
Proepithelin
Acrogranin
GP88
PEPI
Epithelin Precursor
Granulin-Epithelin
Epithelin
Granulins
FTD2
GEP
Location (GRCh38)
17:44345108-44353106
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_002087.4
Sequence length
2130.0 nt
GC content
0.6244
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-909.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-947.87 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
489.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GCUGCUGCCCAAGGACCGCGGAGUCGGACGCAGGCAGACCAUGUGGACC… | 2130 nt | 0.6244 |
Summary
Granulins are a family of secreted, glycosylated peptides that are cleaved from a single precursor protein with 7.5 repeats of a highly conserved 12-cysteine granulin/epithelin motif. The 88 kDa precursor protein, progranulin, is also called proepithelin and PC cell-derived growth factor. Cleavage of the signal peptide produces mature granulin which can be further cleaved into a variety of active, 6 kDa peptides. These smaller cleavage products are named granulin A, granulin B, granulin C, etc. Epithelins 1 and 2 are synonymous with granulins A and B, respectively. Both the peptides and intact granulin protein regulate cell growth. However, different members of the granulin protein family may act as inhibitors, stimulators, or have dual actions on cell growth. Granulin family members are important in normal development, wound healing, and tumorigenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.