Basic Information

Symbol
GRWD1
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Rich WD Repeat Containing 1 WDR28 GRWD RRB1 Glutamate-Rich WD Repeat-Containing Protein 1 Regulator Of Ribosome Biogenesis 1 Homolog (S. Cerevisiae) Regulator Of Ribosome Biogenesis 1 Homolog CUL4- And DDB1-Associated WDR Protein 4 Glutamate Rich WD Repeat Protein GRWD WD Repeat Domain 28 KIAA1942 DIAR14 CDW4
Location (GRCh38)
19:48445824-48457022
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_031485.4
Sequence length
5361.0 nt
GC content
0.5939

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2206.52 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2296.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1745.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_031485.4 NCBI
GUCAGCAGCGAGAGGGUUCGAAGAUGGCGGCGCGCAAGGGUCGGCGGCG… 5361 nt 0.5939
Summary

This gene encodes a glutamate-rich protein that contains five WD-repeat motifs. The encoded protein may play a critical role in ribosome biogenesis and may also play a role in histone methylation through interactions with CUL4-DDB1 ubiquitin E3 ligase. [provided by RefSeq, Feb 2012]

Forensic Context

A study in zebrafish demonstrated that the GRWD1 transcript, a glutamate-rich WD repeat-containing protein 1 functioning as a histone-binding/chromatin regulator, showed increased abundance at 1 and 24 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].