Basic Information

Symbol
GSK3A
RNA class
mRNA
Alias
Glycogen Synthase Kinase 3 Alpha Serine/Threonine-Protein Kinase GSK3A Glycogen Synthase Kinase-3 Alpha EC 2.7.11.26 GSK-3 Alpha EC 2.7.11.1 EC 2.7.11
Location (GRCh38)
19:42226225-42242625
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_019884.3
Sequence length
2193.0 nt
GC content
0.6147

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-921.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -954.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 497.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_019884.3 NCBI
GCUGGGCCGGAGCCGGAGCCCAAGCCAGAGCGGCGCGGCCUGGAAGAGG… 2193 nt 0.6147
Summary

This gene encodes a multifunctional Ser/Thr protein kinase that is implicated in the control of several regulatory proteins including glycogen synthase, and transcription factors, such as JUN. It also plays a role in the WNT and PI3K signaling pathways, as well as regulates the production of beta-amyloid peptides associated with Alzheimer's disease. [provided by RefSeq, Oct 2011]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the GSK3A mRNA was down-regulated in the frontal cortex of ethanol-preferring AA rats compared to ethanol-avoiding ANA rats, as identified through DNA macroarray analysis [Worst et al. DOI:10.1002/Jnr.20496].