Basic Information

Symbol
GSN
RNA class
mRNA
Alias
Gelsolin Actin-Depolymerizing Factor DKFZp313L0718 Brevin AGEL ADF Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Gelsolin (Amyloidosis, Finnish Type) Amyloidosis, Finnish Type AMYLD4
Location (GRCh38)
9:121201324-121334721
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_198252.3
Sequence length
2595.0 nt
GC content
0.5850

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1055.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1096.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 870.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000177.5 NCBI
GCCGACUGGGUCCCCUGCCGCUGUCGCCACCAUGGCUCCGCACCGCCCC… 2619 nt 0.5983
NM_001127662.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2502 nt 0.5851
NM_001127663.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2707 nt 0.5840
NM_001127664.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2674 nt 0.5826
NM_001127665.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2669 nt 0.5860
NM_001127666.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2666 nt 0.5799
NM_001127667.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2657 nt 0.5804
NM_001258029.2 NCBI
GUGUCAGGAGAGGCCCACAUAGCUCCCCCCAGCCUCGCGAUGGCCGAGG… 2525 nt 0.5846
NM_001258030.2 NCBI
CCCUCCUCCGUGGCUCUGUUGGGCCAUGGGUGCUCCCUCCUUUGUGCUC… 2657 nt 0.5785
NM_001353053.1 NCBI
ACCGCCGACCCACGGGCUAGCCACGGCCUGACGGGGCCUGGCCCCGGGG… 3529 nt 0.5684
Showing 1 to 10 of 36 entries
Summary

The protein encoded by this gene binds to the "plus" ends of actin monomers and filaments to prevent monomer exchange. The encoded calcium-regulated protein functions in both assembly and disassembly of actin filaments. Defects in this gene are a cause of familial amyloidosis Finnish type (FAF). Multiple transcript variants encoding several different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GSN exhibited early expression changes and a pI shift towards basic pH in serum following selective dorsal skin exposure to 40 Gy of ionizing radiation, as part of a proteomic investigation into radiation-induced cutaneous lesions [Guipaud et al. DOI:10.1002/pmic.200601032].