Basic Information

Symbol
GSN
RNA class
mRNA
Alias
Gelsolin Actin-Depolymerizing Factor DKFZp313L0718 Brevin AGEL ADF Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Gelsolin (Amyloidosis, Finnish Type) Amyloidosis, Finnish Type AMYLD4
Location (GRCh38)
9:121201324-121334721
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_198252.3
Sequence length
2595.0 nt
GC content
0.5850

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1055.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1096.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 870.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001353054.1 NCBI
ACCGCCGACCCACGGGCUAGCCACGGCCUGACGGGGCCUGGCCCCGGGG… 3458 nt 0.5703
NM_001353055.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2634 nt 0.5862
NM_001353056.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2699 nt 0.5839
NM_001353057.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2587 nt 0.5848
NM_001353058.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2800 nt 0.5811
NM_001353059.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2924 nt 0.5790
NM_001353060.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2649 nt 0.5844
NM_001353061.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2808 nt 0.5812
NM_001353062.1 NCBI
GAGGGGCCAAAGAGCCUUGGAAGAGGACAGAGCUCUCUGUCCUCAAGAU… 2669 nt 0.5766
NM_001353063.2 NCBI
GGAACCAGCUGAGCGCAGCUGGACCCAGCAGCCGCUGUCUCCAGUGCCG… 2564 nt 0.5803
Showing 11 to 20 of 36 entries
Summary

The protein encoded by this gene binds to the "plus" ends of actin monomers and filaments to prevent monomer exchange. The encoded calcium-regulated protein functions in both assembly and disassembly of actin filaments. Defects in this gene are a cause of familial amyloidosis Finnish type (FAF). Multiple transcript variants encoding several different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GSN exhibited early expression changes and a pI shift towards basic pH in serum following selective dorsal skin exposure to 40 Gy of ionizing radiation, as part of a proteomic investigation into radiation-induced cutaneous lesions [Guipaud et al. DOI:10.1002/pmic.200601032].