Basic Information

Symbol
GSPT1
RNA class
mRNA
Alias
G1 To S Phase Transition 1 ERF3a ETF3A GST1 Eukaryotic Peptide Chain Release Factor GTP-Binding Subunit ERF3A Eukaryotic Peptide Chain Release Factor Subunit 3a G1 To S Phase Transition Protein 1 Homolog Eukaryotic Release Factor 3a EC 3.6.5.- 551G9.2 ERF3A
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_002094.4
Sequence length
7141.0 nt
GC content
0.4102

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2038.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2179.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2318.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((((((.((((.((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((.((((((...(((..((((((((((((((((((..((....)).))))))).(((((((.((...(((((((((((((.................((((...((.....))..))))(((.(((((.(((((.((((......(((((.........(((.....)))....))))).)))).))))).))))).))))))))))).))))).)))))))))....)))))))))))..))))))))).))(((((....(((((....(((..........))))))))..))))).))))))))))))))))......)))))))))))).((((((..(((.(((...)))..))))))))).....)))).))))))(((..((((..((((((((.((((........(((.((((..((((((..(((((......)))))..(((.(((((((((........))))))))).)))......))))))..)))).)))((((((....))))))((((.(((((((.(((((....)))))...(((((((...(((((((.......((((((((((((((((....(((((.(((((......)))))...((((....))))(((((((((...((((((((.((.(((...................(((((((.....)))))))((((((...(((((((((......(((((((((((..........(((....((.....))....)))...(((..((..(((((....))))).))..)))....((((....))))....)))).))))))).......)))))..((((((((((...((.((((((...)))))).))..))))))))))....((((((((((................((((((((.....(((((((((((.(((.(((((...((((((((((((((((((((...((..(((.((.(((((......((((((((((..((((...(((((....)))))....)))))))))..)))))..))))).))(((((((..((((((...)))).))..)).)))))..)))))...))))))))..))).)))((((((((((((((((((.....(((((((.((((.............((.((((((.(((((((((....(((((((((..((((((((((...)))))).(((((.((((((.((....((((...))))...)).)))))).)))))..((((((....((((((.((......))...((((.((((....)))).)))).......((.....))))))))..(((((((((((((..(((((((.(((((((..((((((.(.((((..((.(((((((((((((((...((((...........))))))))((((.(((((.((...(((((((...(((((((((((((((..((((((.....(((((......))))).......))).))))))))).(((...(((((.(((((..(((((.(((........)))((((((..((....)).)))))).((.((.((((((.........)))))))).))..)))))..))))).))..))))))((((....))))....)))).))))).....)))))))....)))))))..))))((((((.((((((....((((.......((((((..(((((..((((....).))))))))..((((.(((..(((((.....(((.((..((....)).)).)))..)))))..))).))))(((.(((((((((..((.......))..)))))))..))..))).)))))).....))))....))))))))))))......(((((((...))))))).((((..((...))..))))))))))))..))).))..)))))))))))..........(((((((((...((((......)))).......)))))).)))((..(((((..(((((.((((....))))..)))))(((((((........)))))))......(((.((((....)))))))....(((((((((((((....))))(((((((...(((......((((((...(((....(((((...((.....))...)))))....)))........(((((((((((...(((((((.......)))))))..(((((((((.....(((((((....)))))))((((((..(((................))).....))))))...)))).))))).......))))))))))).....((((((....((((((((((....))...........)))))))).......))))))....................)))))).......)))...))).))))((((((((((..(.((((((((...................((((((.((((((....))))))...)))))))))))))).)..))))..........((((((((...))))))))...............(((((((((.(((.....))))))))))))............(((((((........(((((((..(((.........)))...))))))).....)))))))......((((((...((....)).)))))).)))))).))))))))).........)))))..)).....))))))).)))))))(((((((.......(((((((..(((..((((((((((.(((((..............((((((((((.((((((((........)))))))).)))))).))))..............))))))))))).............(((((((((((.((....))))))))))))).....((((((.....))))))(((..(((((.........((((((((.((((((..((((((.....).))))).)))))).))..)))))).......)))))..)))..((((((((.....(((.....)))..))))))))...(((((((((.......(((......)))...))).)))))).))))..))).)))))))((((((.((....)).))))))..)))))))....((.((.....)).))....)))))))))))))...))))))...............((((((....))).))).....))))...))))))))))))))))))..))...(((((((...))))))).(((((...........)))))))))))...(((.((((((............)))))).)))....((((..(((((((.......((((((.....)))))).......(..(((..(((.((((((.(((((.((..((..((((((..(......)..))))))..)).))))))).....)))))).)))..)))..)...........(((((............(((((((...(((((......)))))((((((((....(((((......)))))....)))))))).....(((((((.....)))))))..))))))))))))(((((((((.(....)))).)))))).))))))))))))))).)))))))..))))))).(((((....)))))..))))))))))).)).))))...)))))))).))))..))))))).))))))))((((((...)))))).......(((((((..(((.....))))))))))))))))).)))...(((((((((((((((.......))))).....))).)))))))..(((((......)))))((((........))))....((((((.....)))))).)))).))))))..(((((((((...))).))))))..(((((...(((((((((((((...((....))....))))...)))).)))))....)))))....))).)).))))))))))))))))).......((((((................)))))))))))...))))))))))...............(((....)))((((((((............))))))))((((((..((((.....))))..((((((..(((((((((((....))))(((((........((((.((.((((((.......))))))..))..))))........)))))(((((((((((((((....)))..)))))....)))).)))...(((((....((....))....))))).((((..(((....)))..)))).....((((((((..(((((((....)))))))...((((((((.((((.....((((.((((....((((((((((.........((((((((((((((((.((..(((.(((....))).))).)))))))))..((((......))))..(((((((((((((...........))))))).))))))....((((((((((((((((.(((..(((((((((((((((((((...(((((.(((((((((((((.((((........((((....))))........)))))))))))))....)))).)))))((((((......)))))).))))))........)))))))))......)))).....))).)))))))..)))).)))))((((.....)))).........(((((((((((((((((((((((.........)))))))))))...............)))))))))))).........(((((.((((.......)))).)))))..((((((.((((((......(((((((.(((((....))))))))))))...............((((.....))))..)))))))))))).......((((((((((((..........)))))))...))))))))))))))...........(((((((((.....(((((..(((.(((((((((...(((....((((....))))...))).....))))).)))))))..)))))))))))))).))))))))))......(((.((.(((.....((((((...(((...((((((((.....)))))))).(((((((((...))((.((((......)))).))...((((((((((((((.(((......))))))))...))))))))).....(((((((((.((((..((((((((..(((.(......)))).........(((...)))((((((((.(((...((((.(((.((((((.......))))))..))).)))).))).................((......))(((((((((((((((((((((((((.(((((((.......)))))))..)).)).)))).))))...))))))))...))))).))))))))........)))))))))))).)))).)))))....))))))).............))).)))))).....))).)).))).....)))).)))))))).))))))))..............(((((..(((.(((((((...(((((.............))))).....))))))))))..)))))))))))))...)))))))..))))))..............))))))........))))))))))))).))))))))))).))).))))...(((((.(((((((....((((.((...(((((....)))))...)).))))....(((((((..(((((........))))).....)))))))..(((........)))(.(((((((((...((((.((((((..(.......((((((.((((.......((((((((.((((((..((((((((....(((.((((((((.((((((.((((((((..............)))))))).)).))))....))).))))).))).(((((((((((.........))))))))))))).))))).)..........)))))).))))))))........)))).))))))....)..))))))..))))))))))))).).......))))))))))))...)))).)))))).))..).)))..))).........((((((((((....))))))))))....(((.(.(((((.......((((.((((((((((((((((((((........)))))......))))....))))))))))).))))....))))).).)))((.............))...(((((((.........((((((((((......)))).)))))).)))))))))))))))...((((((((.(((((.((((((((((.(.(((((.((.........((((((..(((((((.....)))))))))).))))).))))).))))))))))).(((((((((((((((......))))))............(((((((((((((((((((((((....))))).(((...((.((((((((..(((.((........)).)))..)))))))).))..)))((((((((((((.((((...))))..(((((.((((...(((....(((((..((.(((((....))))).))..)))))....)))))))))))).................))))))))))))((.(((((.....))))).)).))))))...)))))))......)))))))))))))).....((((((((((....)))))))))).......))))).....)))))))).....)))..))))))))((((((....))))))(((....)))....(((((((((((..........((((((((.......))))))))))))))........)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{,,,,,{{,{(((.(((((((((((,((((((((((((((((.((((((((((((((((,((.((((((...(((..((((((((((((((((((..((,...}}.})))})}.(((((({{((...(((((((((((((............,....((((...((.....))..))))(((.(((((.(((((.((((.,,..,({,,..........{|{.....}}}..,.,)))}.)))).))))).))))).))))))))))).))))).)))))))))....)))))))))))..))))))))).))|{{||.,,|{{{((.,..(({.,.,...,..}}}}}}}}||}}))).)))))))))))))))),....,)))))))))|||.((((((,.((({(({...))}.|)||))))}},.|,}}||}.}}},||{,...,{|,..,|,,|}||||,,..},||,,,{|||||||,|{{{|{||||{{{|.,}|}}}))))},|||.(((((((((......,.))))))))).|||,...,{{{{|||{{{|||{|||(({({{...}))))))})).,||||}}..(((((....))))|{{{{(({{{{(,(((((((((...,.{{(((...))).)}))))))))}.}.|(((((,.....}}}||.((((((....)))))),,{{{{{{(({({{{{{(({..,{,,{,,,{,,{{{..(({{{((((((((({(({((({(((({{,,((,,{,{|{{{{{.,,...(((((((((({..,{{,,{{{,((,...{{...,})}....)))...||{.,((..(((((....))))).})..,},....((((....))))..,.})))}}))))))...,,{{|||||,.((((((((((..,({.((((((...)))))).))..))))))))))....({{{((((((..,{{..,,,,,.,.,((({{(((,....{(((({{,{{{,(({.(((((,,,({{({{{,{,,.{{{{|{{{,..{,.,|||||||{(((,......{{((((((((,.{{||}|,||||{....}}}}},,..}}|||||||{.|}}}|{,}||}}.}|((((({(..{{{{({...}}}}.}}..))}|||||{{|||}}.,,||}}}}})}})||{({.((((((((((({((({,({{{{,(((((((.((((..,,......,(((({({{,((,(((({((((,...(((((((((..{(({((((((...)))))).(((((.((((((.{{..,.((((...)))).,.,}.)))))).))))).,(((({(,,,,((((((.,(,,,,..||.,.((((.((((....)))).)))).....,,{,.....}})))))}.,{{{{((({{(((({{({{{{{,,|{{|||{..((((({{(.((((..((.((((((((((((({....((((.{{.....,,.))))...,((((.{((((.((...(((((((...(((((((((((((((..((({{(,{{..(((((......))))).......))).))))))))),(((...(((((.(((((..(((((.{{{........}},((((((..{(....)}.))))))..,.{..|,..||{,{(((((....)))))).),.)))))..))))).)),.})))))|(((....)))}....))))}})))).....)))))))....)})))))..))))((((((.((((((....((((.,,....((((((..(((((..(((,....}.))))))))..|{({.{{{.,({{{{.....{{{..{,,((..,,||.,..}}}.,}}|}},.}}}.}}}|(((.{({{{{{{(..{(,......}).,)))))),..)),,)))})))))}..,,.))))....))))))))))))......(((((((...))))))).,(((,.{{..,)),.)))))))))))).,})).))..)))))))))))........,.({{((({{{...|{{(.,,,..}}||....,..)))))}.}}}.,{,||||...{{({{.((({....}))),,||}}}(((((((........})))))},..},,|{(.((((....})))|||....{((((((({((((....))))(((((((...(((..,,..((((((...{((....(((((...((.....))...)))))....))}........(((((((((((..,(((((((.......)))))))..(((((((((.....(((((({....}))))))((((((..(((................))).....))))))...))))},))))...,...))))))))))).....((((((....((((((((......||...........)))))))).......))))))....................))))))..,....))).}.))).))))(((((({{,{{{{.{({{(({{,,...,..}},........,{((({.{{((((....}))))}.,,}}}}|}}|||}}|||||,||||{.,,,..,,,{(((((((...)))))))}}},..,..,......(((((((((.(((.....)),)))))))))............{{{{{{{........{{{{{{{,,{{{.,,...,|,}}}},.))}}}}}....,))})))},,,...{(((((...((....)).)))))}})))))).))))))))).,.,}}},,})}},,}}}},,.,})}}}}},}})})))||{{{{{.|||,,,|||{|||||{{|,.||||{{{{,,.|||||...,,||.||||}}{(((((((((.((((((((........)))))))).)))))).)))}....,,,,,,.,,,},}}}}}}}}}|,.....,|||,.(((((((((((.{{....}}))))))))))).....((((((.....))))))(((..(((((......,..((((((((.((((((..((((((.....),})))).)))))).))..))))))..,....)))))..)))..((((((((.....(((.....)))..))))))))...((((((({,{{{....(((......)))...))),)))))).}}},,,|||{|,,,,})|||||{.,,,{{{||,||}||,..|}}|}},...,{{,((,,,,.}|,}..,,,|}}}}}}}}}}}||,.}}}}||{{,,...,,,,}}}}|{{{{{....))),,}}....,)))}...))))))}}})})}}}}}}.,||,,,(((((((...))}}))).{{{{({{{{{..{{{{,||,}||||,,.......(((......}}}.{((((((((........))))))))}(({(((.,,{,|.((((({.....)))))).}|||||,.||,{|,|||,||,||}}|||||,},},}}}}||||||..|},}},,}..)))))}.{{{{.{{|{|{{,,.....}}}}))))),)))}.........}}}|,|||}}.......,..(((((((...(((((......)))))((((((((.,,.(((((......))))).,,.)))))))).....(((((((.....)))))))..)))))))((((((((((((((.{....}))).)))))))..)))),.,,,)))).)))))))..))))))},|{{{,....|||||..||||||}}}}}.||,||||,,,||||||,}|||},..,}}))),.))))}}))||||{{..|)))))}.......(((((({..({|.....,)})))))))}}}})}),})).,,|||||||||{{|||||.,|.},))))}||||,)))|))))))}|}||,,,,}}}}.,)})},,||....,}}}))}}..||((((((.....)))))).))},..{(((,..(((((({((...}}}.})))))...}|||,,.,....,,....,,||||{....})||||,,{({,.{{||{|||||{{{{.||||{{{{|,,}}{{{|||{{{{|||||(((({.,,{.(((((((............,,,.))))))}..}}}..}}}}}{(((|.,,..,,,...,,.}|||,...,((((((((((,{.......}),)))))))))).,},..||||.....))))}}|||||||}||||,|,|{{{....}}}|,..,,,,,..,{{{{{{{{,.(((|,((((.........{{{.(((((((.(((((,,{({.(((((((.((((((((....)))..))))).......{{{{{{{{(((((....({....))....))))).((((..(((....)))..)))).....{{({{{|||.(((((((....)))))))...{{...,||...,|||..|}}|||{{{........,,||||,,..,,,}},},|{((,,(((((((,{((..(((.(((....))).))).)))))))))).|||{}}}.},)))}..(((((((((((((...........)))))))}})))))...(((((.((((((((,{...(((.({{((((,(.(({....}},,)))))).)))...|,,,})))})))})))).})))))).}))))))))))))))).}}},.||||||||||||}.|||.,{(((((......)))))}.}},))),..))}}},.))))))}..,{{|,},..,,,})}}.|||||,,,,}}},..}},))))),.................(((((((((((({((((((((((.{{....,.})))))))))},..............)))))))))))).........(((((.((((,......)))),))))),.{{{{{|}||{{||,..}},||||||.||||||,,,.))))})})))))},,}.,,,,..,,..{{,,..,,,))))},)))})})))})),}}}}}}}||,.(((((((..........))))))).,,,..,.||||||||{{..........(((((({{{.....{(({(..,{{.((((({{{{..,|||,,..((({....}))}...,||{{{{.,||,|||}}}|||{,|,||}|||,},,}|,}}})),))))}}..}}},}),,)))}})..}}}}}}}}}}))).}}{(((((((.....)))))))}.|}}))))))),))}((.((((......)))).))...((((((((((((({{(((......))))))))...)))))))))..,,,((((({({...{,|,,,.,,||||||{||||..,..}}}}}..........(({{,|,,||)))))){{|||||.,{{,{,((((({...|||||..,,.}},}||}|}},,,}}}}}},.............((......)){{{{{{{({{{(((((({{({{{{{,{{{{|{{.......}))}))},.}}.}),}))}}})))...))))))))...|}})|,|||{{|||{{,..,,,||||}|||||||{,|||{||||.{{{{||||..{{{{,.,.......,,,.,,))))}}..|||({{{,{{,,},}}}})),))))).})})}}||||},,.|||||,,|||{|{(((|,(({.(((((({...(((((..........,,.)))))...,.))))))),,},,,,}},}|||}}}},...{{{||,......,}.))))}......,,||{{.,...,,||,,{|||,||{{,..{||||}},,,|||}||,,}},,}}},},..,||{{{|{{{{(((({{{{,,{(((({{{{|||||,,{{|{|||}.,,.(({((((..(((({...,,...))))}.....))))}}},,|{{..,.....|||{|{{{{{{|||.,.{||,.{{((((..{...,.|.{{{(((.((((.......((((((({.{{{{{{,,||{|||||,,..|||||{{|,||{||||||||||||{{{|....,....,,,,.}))))))).))})))),,,,},)}))}},,))),(((((((((((.........))))))))))),|,,}|||||..,,,,,...}}}}}}.}}}}}}|}......,.|}}}.}|||}|...|||||}}|||,||,,,}}}}})})},))))),..}}}}}}....,,,.{|||{{{|{.}|||||{|||{(({{{.,........{{{{{{{{{|,,,,)}}}}|||||....((({{.(((((.......((((.((((((((((((((((((((.,....,.)))))}.....,)),...,))))))))))).))))....)))))|},)}}}||||,....||,|,|||,.{||||||,,,,|{{{.{((({(((((,..,,,||||||||||||,}.((((....))))....|||||||..{((...,.))),,}})))))},,)}}.,,}}}}},,,,,|,,,,,,{{{|.,,,.)}))((((((((({.(((((........))))).,)))))))))((((((......)))))).....,,|||||||,{|{{{{{|{,,..,{{{({{,,..||||,.,}..}}}||||||||||.,|||}||}},}.}}}))}))),,|||}}|||,..{{|||{{{.,||||{{,{{{{{,..||||{{|||||,||||||||,|..,}|||{||,|{}|,,||,,}}}})))}})}}))}|},,}))))}}}}}}},,,,.....,.........||||}}|||||.,|},.}}))),},,)))}}}),,}}}}},,}}}}},.{{{{{..,,,))))),}}||||....((((((((((....)))))))))).....||}|}.,,))})})}})}),})))})))},)))),)))||||||,,,,})})}}{((....)))..,.,{{{{((((((,.........{(((((((.......)))))))))))))),,,,,,,}})},.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCUCACACACACGAGGAGGAGGGUUGAGCUGCCGCCGCCGCCGCCUCUG… 7138 nt 0.4102
ACACUGCAGUUUUAAGCCGGAAUAUCUCACGGUUUUAUUGUUUCUUCCA… 7166 nt 0.3967
GCUCACACACACGAGGAGGAGGGUUGAGCUGCCGCCGCCGCCGCCUCUG… 7141 nt 0.4102
Summary

Enables GTPase activity and translation release factor activity. Involved in regulation of translational termination and translational termination. Acts upstream of or within protein methylation. Part of translation release factor complex. Is active in cytosolic ribosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human sepsis patients identified the GSPT1 as a prognostic biomarker, finding it was lowly expressed in the Survivor group compared to the Non-survivor group [Chen et al. DOI:10.1038/s41598-024-78502-3]. A study in Sarcophaga peregrina evaluated ten candidate reference genes for RT-qPCR normalization across different temperatures, identifying 18S rRNA and 28S rRNA as the most stable [Shang et al. DOI:10.1093/jme/tjz137].