Basic Information

Symbol
GTF2H4
RNA class
mRNA
Alias
General Transcription Factor IIH Subunit 4 TFIIH TFB2 P52 General Transcription Factor IIH, Polypeptide 4, 52kDa TFIIH Basal Transcription Factor Complex P52 Subunit General Transcription Factor IIH Polypeptide 4 Basic Transcription Factor 2 52 KDa Subunit BTF2 P52 General Transcription Factor IIH, Polypeptide 4 (52kD Subunit)
Location (GRCh38)
6:30907522-30914119
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001517.5
Sequence length
1712.0 nt
GC content
0.5683

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-679.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -707.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 488.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001517.5 NCBI
ACUCCUCCCCUUACCUCCCUUCUCUUCUGAAUUCUCCAUUCUGGGCUCU… 1712 nt 0.5683
Summary

Enables RNA polymerase II general transcription initiation factor activity. Involved in transcription by RNA polymerase II. Located in nuclear speck. Part of core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex and transcription factor TFIID complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the GTF2H4 as a potential transcriptional regulator significantly associated with myocardial ischaemia reperfusion injury (IRI) following percutaneous coronary intervention, showing a positive correlation with IRI and enrichment in the cellular response to stress within a constructed lncRNA-mRNA ceRNA network [Liu et al. DOI:10.1111/jcmm.14163].