Basic Information

Symbol
GTSE1
RNA class
mRNA
Alias
G2 And S-Phase Expressed 1 Lnc_bc060912 GTSE-1 B99 G2 And S Phase-Expressed Protein 1 G-2 And S-Phase Expressed 1 Protein B99 Homolog
Location (GRCh38)
22:46296870-46330810
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016426.7
Sequence length
2983.0 nt
GC content
0.5377

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1068.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1120.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 665.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_016426.7 NCBI
GUCUCCCGGCGCCGCGUUUAAAUCCGUGCCGGAGGCGCGUCCUGCAUCG… 2983 nt 0.5377
Summary

The protein encoded by this gene is only expressed in the S and G2 phases of the cell cycle, where it colocalizes with cytoplasmic tubulin and microtubules. In response to DNA damage, the encoded protein accumulates in the nucleus and binds the tumor suppressor protein p53, shuttling it out of the nucleus and repressing its ability to induce apoptosis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that asarum administration induced hepatotoxicity, with transcriptomic analysis revealing upregulation of the GTSE1 as part of the p53 signaling pathway [Cao et al. DOI:10.3892/Etm.2020.8811].