Basic Information
Symbol
GUSB
RNA class
mRNA
Alias
Glucuronidase Beta
Beta-Glucuronidase
EC 3.2.1.31
Beta-G1
Beta-D-Glucuronidase
Glucuronidase, Beta
MPS7
BG
Location (GRCh38)
7:65960677-65982283
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
Postmortem interval inference
MANE select
Transcript ID
NM_000181.4
Sequence length
2199.0 nt
GC content
0.5553
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-812.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-851.91 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
748.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGACGGUGGCCGAGCGGGGGACCGGGAAGCAUGGCCCGGGGGUCGGCGG… | 2199 nt | 0.5553 | |
| AGACGGUGGCCGAGCGGGGGACCGGGAAGCAUGGCCCGGGGGUCGGCGG… | 1761 nt | 0.5588 | |
| AGACGGUGGCCGAGCGGGGGACCGGGAAGCAUGGCCCGGGGGUCGGCGG… | 2014 nt | 0.5492 | |
| AGACGGUGGCCGAGCGGGGGACCGGGAAGCAUGGCCCGGGGGUCGGCGG… | 1871 nt | 0.5532 |
Summary
This gene encodes a hydrolase that degrades glycosaminoglycans, including heparan sulfate, dermatan sulfate, and chondroitin-4,6-sulfate. The enzyme forms a homotetramer that is localized to the lysosome. Mutations in this gene result in mucopolysaccharidosis type VII. Alternative splicing results in multiple transcript variants. There are many pseudogenes of this locus in the human genome.[provided by RefSeq, May 2014]
Forensic Context
A study in human heart tissue demonstrated that high-quality mRNA, including the GUSB used as an internal control, can be extracted from post-mortem samples, with its expression levels being independent of the post-mortem interval in non-degraded RNA samples [Partemi et al. DOI:10.1016/j.forsciint.2010.07.005]. Another study in human lung tissue from forensic autopsies validated the GUSB as one of the three most stable reference genes for mRNA normalization in quantitative PCR analyses across various causes of death [Du et al. DOI:10.1111/1556-4029.13199].