Basic Information

Symbol
GXYLT1
RNA class
mRNA
Alias
Glucoside Xylosyltransferase 1 GLT8D3 Glycosyltransferase 8 Domain-Containing Protein 3 Glycosyltransferase 8 Domain Containing 3 FLJ43151 EC 2.4.2.42 EC 2.4.1
Location (GRCh38)
12:42081845-42144874
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_173601.2
Sequence length
7492.0 nt
GC content
0.3769

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2047.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2199.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2030.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001099650.2 NCBI
AGAGGCGGUGUCCAGGCUUCCGGGCGGGUAGUCCUUCGGCUCCGGAGCC… 7399 nt 0.3761
NM_173601.2 NCBI
AGAGGCGGUGUCCAGGCUUCCGGGCGGGUAGUCCUUCGGCUCCGGAGCC… 7492 nt 0.3769
Summary

GXYLT1 is a xylosyltransferase (EC 2.4.2.-) that adds the first xylose to O-glucose-modified residues in the epidermal growth factor (EGF; MIM 131530) repeats of proteins such as NOTCH1 (MIM 190198) (Sethi et al., 2010 [PubMed 19940119]).[supplied by OMIM, Mar 2010]

Forensic Context

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