Basic Information

Symbol
ALOX15
RNA class
mRNA
Alias
Arachidonate 15-Lipoxygenase 15-LOX-1 Polyunsaturated Fatty Acid Lipoxygenase ALOX15 Arachidonate 12-Lipoxygenase, Leukocyte-Type Arachidonate Omega-6 Lipoxygenase Hepoxilin A3 Synthase Alox15 Linoleate 13S-Lipoxygenase 12/15-Lipoxygenase 12-LOX 15-LOX LOG15 15-Lipoxygenase Type 1 15-Lipooxygenase-1 15-LOX Type 1 EC 1.13.11.31 EC 1.13.11.33 EC 1.13.11.12 EC 1.13.11.- EC 1.13.11
Location (GRCh38)
17:4630919-4642294
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001140.5
Sequence length
2697.0 nt
GC content
0.5458

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1013.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1059.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 856.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001140.5 NCBI
AGAAGGAGCGAAACAUCUUUGAGCAAGAUGGGUCUCUACCGCAUCCGCG… 2697 nt 0.5458
Summary

This gene encodes a member of the lipoxygenase family of proteins. The encoded enzyme acts on various polyunsaturated fatty acid substrates to generate various bioactive lipid mediators such as eicosanoids, hepoxilins, lipoxins, and other molecules. The encoded enzyme and its reaction products have been shown to regulate inflammation and immunity. Multiple pseudogenes of this gene have been identified in the human genome. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that skeletal muscle contusion induces iron overload and ferroptosis, characterized by increased Fe2+ and MDA alongside decreased GSH and GPX4, which was reversed by ferroptosis inhibitors [Yang et al. DOI:10.3390/ijms252011317].