Basic Information

Symbol
HADH
RNA class
mRNA
Alias
Hydroxyacyl-CoA Dehydrogenase SCHAD HADHSC HADH1 Medium And Short-Chain L-3-Hydroxyacyl-Coenzyme A Dehydrogenase L-3-Hydroxyacyl-Coenzyme A Dehydrogenase, Short Chain Hydroxyacyl-Coenzyme A Dehydrogenase, Mitochondrial Short-Chain 3-Hydroxyacyl-CoA Dehydrogenase EC 1.1.1.35 HCDH HAD Testis Secretory Sperm-Binding Protein Li 203a Hydroxyacyl-Coenzyme A Dehydrogenase EC 1.1.1 MSCHAD HHF4 HAD1
Location (GRCh38)
4:107989714-108035241
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005327.7
Sequence length
1803.0 nt
GC content
0.4615

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-552.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -586.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001184705.4 NCBI
CUUCCCUGCCCGGGUCUCCUCGCUGUCGCCGCCGCUGCCACACCAUGGC… 1854 nt 0.4601
NM_001331027.2 NCBI
AUUCAGGAGGAGUAACUGGAAGCCAUAACCAUGAACUUCCAUAUCUGUC… 1934 nt 0.4421
NM_005327.7 NCBI
CUUCCCUGCCCGGGUCUCCUCGCUGUCGCCGCCGCUGCCACACCAUGGC… 1803 nt 0.4615
Summary

This gene is a member of the 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase gene family. The encoded protein functions in the mitochondrial matrix to catalyze the oxidation of straight-chain 3-hydroxyacyl-CoAs as part of the beta-oxidation pathway. Its enzymatic activity is highest with medium-chain-length fatty acids. Mutations in this gene cause one form of familial hyperinsulinemic hypoglycemia. The human genome contains a related pseudogene of this gene on chromosome 15. [provided by RefSeq, May 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the HADH gene, involved in lipid metabolism, was downregulated in the adipose tissue of heavier co-twins within BMI-discordant monozygotic twin pairs, indicating its role in the mitochondrial dysfunction associated with acquired obesity [van der Kolk et al. DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100226]. A study in rats demonstrated that the HADH (Hadhb) was identified as a potential regulator of methamphetamine reward and addiction via transcriptome profiling of whisker follicles, showing a down-down regulated expression pattern (0.69 at MASA, 0.48 at WD) and a betweenness centrality score of 0.0147, and it was previously reported as an addiction-related gene [Song et al. DOI:10.1038/s41598-018-29772-1].