Basic Information

Symbol
HAO1
RNA class
mRNA
Alias
Hydroxyacid Oxidase 1 GOX GOX1 Hydroxyacid Oxidase (Glycolate Oxidase) 1 2-Hydroxyacid Oxidase 1 Glycolate Oxidase 1 Glyoxylate Oxidase HAOX1 GO (S)-2-Hydroxy-Acid Oxidase Glycolate Oxidase EC 1.1.3.15 EC 1.2.3.5
Location (GRCh38)
20:7882985-7940520
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017545.3
Sequence length
1757.0 nt
GC content
0.4400

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-523.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -558.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 481.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_017545.3 NCBI
AACGAACUCCAUCUGGGAUAGCAAUAACCUGUGAAAAUGCUCCCCCGGC… 1757 nt 0.4400
Summary

This gene is one of three related genes that have 2-hydroxyacid oxidase activity yet differ in encoded protein amino acid sequence, tissue expression and substrate preference. Subcellular location of the encoded protein is the peroxisome. Specifically, this gene is expressed primarily in liver and pancreas and the encoded protein is most active on glycolate, a two-carbon substrate. The protein is also active on 2-hydroxy fatty acids. The transcript detected at high levels in pancreas may represent an alternatively spliced form or the use of a multiple near-consensus upstream polyadenylation site. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in Apoe-/- mice demonstrated that cigarette smoke exposure dysregulated peroxisomal lipid metabolism, with the HAO1 being downregulated in the liver, an effect that was reduced upon switching to a candidate modified risk tobacco product or cessation [Lo Sasso et al. DOI: 10.3109/08958378.2016.1150368]. These molecular changes were substantially reduced in mice exposed to a candidate modified risk tobacco product or following smoking cessation.