Basic Information

Symbol
HAPLN3
RNA class
mRNA
Alias
Hyaluronan And Proteoglycan Link Protein 3 HsT19883 EXLD1 Extracellular Link Domain Containing, 1
Location (GRCh38)
15:88877294-88895597
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_178232.4
Sequence length
1892.0 nt
GC content
0.6121

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-806.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -840.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 737.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001307952.2 NCBI
AUUUCCCCGAAAUCAGACUGCUGCCUUGGACCGGGACAGCUCGCGGCCC… 2031 nt 0.6076
NM_178232.4 NCBI
AUUUCCCCGAAAUCAGACUGCUGCCUUGGACCGGGACAGCUCGCGGCCC… 1892 nt 0.6121
Summary

This gene belongs to the hyaluronan and proteoglycan binding link protein gene family. The protein encoded by this gene may function in hyaluronic acid binding and cell adhesion. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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