Basic Information

Symbol
HCK
RNA class
mRNA
Alias
HCK Proto-Oncogene, Src Family Tyrosine Kinase Hemopoietic Cell Kinase JTK9 Tyrosine-Protein Kinase HCK Hematopoietic Cell Kinase P59-HCK/P60-HCK EC 2.7.10.2 P59Hck P61Hck EC 2.7.10 AIPCV
Location (GRCh38)
20:32052197-32101856
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002110.5
Sequence length
2101.0 nt
GC content
0.5616

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-798.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -835.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 518.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001172129.3 NCBI
ACCACGUCCCUGGUCCCAGCUCGGGAGCACAUCAGAGGCUUAGAGGCGA… 2101 nt 0.5616
NM_001172130.3 NCBI
ACCACGUCCCUGGUCCCAGCUCGGGAGCACAUCAGAGGCUUAGAGGCGA… 2098 nt 0.5615
NM_001172131.3 NCBI
ACCACGUCCCUGGUCCCAGCUCGGGAGCACAUCAGAGGCUUAGAGGCGA… 2098 nt 0.5615
NM_001172132.3 NCBI
ACCACGUCCCUGGUCCCAGCUCGGGAGCACAUCAGAGGCUUAGAGGCGA… 2167 nt 0.5584
NM_001172133.3 NCBI
ACCACGUCCCUGGUCCCAGCUCGGGAGCACAUCAGAGGCUUAGAGGCGA… 2165 nt 0.5589
NM_002110.5 NCBI
ACCACGUCCCUGGUCCCAGCUCGGGAGCACAUCAGAGGCUUAGAGGCGA… 2101 nt 0.5616
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the Src family of tyrosine kinases. This protein is primarily hemopoietic, particularly in cells of the myeloid and B-lymphoid lineages. It may help couple the Fc receptor to the activation of the respiratory burst. In addition, it may play a role in neutrophil migration and in the degranulation of neutrophils. Multiple isoforms with different subcellular distributions are produced due to both alternative splicing and the use of alternative translation initiation codons, including a non-AUG (CUG) codon. [provided by RefSeq, Feb 2010]

Forensic Context

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