Basic Information

Symbol
HCRTR1
RNA class
mRNA
Alias
Hypocretin Receptor 1 ORXR1 OX1R OXR1 Orexin/Hypocretin Receptor Type 1 Hypocretin (Orexin) Receptor 1 Hypocretin Receptor Type 1 Orexin Receptor Type 1 Orexin Receptor 1 Ox-1-R Ox1-R Ox1R
Location (GRCh38)
1:31617660-31632518
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001525.3
Sequence length
2307.0 nt
GC content
0.5986

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-955.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -991.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 481.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001525.3 NCBI
ACAGCCCGCGCAGUUGCCGCGGAUCGUGCUGAGCCCCGCGAGCCGAGGC… 2307 nt 0.5986
Summary

The protein encoded by this gene is a G-protein coupled receptor involved in the regulation of feeding behavior. The encoded protein selectively binds the hypothalamic neuropeptide orexin A. A related gene (HCRTR2) encodes a G-protein coupled receptor that binds orexin A and orexin B. [provided by RefSeq, Jan 2009]

Forensic Context

A study in Wistar rats demonstrated that exposure to high concentrations of carbon dioxide (60% CO2) induced significant, region-specific mRNA expression changes in the brain, with Agps and Hspb2 significantly increased in the frontal cortex and Ppy decreased and Crhr2 increased in the hypothalamus [Sato et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2015.07.014].