Basic Information

Symbol
HDAC1
RNA class
mRNA
Alias
Histone Deacetylase 1 HD1 GON-10 RPD3L1 KDAC1 Protein Deacetylase HDAC1 Protein Deacylase HDAC1 EC 3.5.1.98 Reduced Potassium Dependency, Yeast Homolog-Like 1 Protein Decrotonylase HDAC1 EC 3.5.1.- RPD3
Location (GRCh38)
1:32291921-32333635
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Forensic tag(s)
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HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004964.3
Sequence length
2118.0 nt
GC content
0.4948

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-687.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -727.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 572.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004964.3 NCBI
CCCCUCCCCCCUGGGUCGGACGCUGAGCGGAGCCGCGGGCGGGAGGGCG… 2118 nt 0.4948
Summary

Histone acetylation and deacetylation, catalyzed by multisubunit complexes, play a key role in the regulation of eukaryotic gene expression. The protein encoded by this gene belongs to the histone deacetylase/acuc/apha family and is a component of the histone deacetylase complex. It also interacts with retinoblastoma tumor-suppressor protein and this complex is a key element in the control of cell proliferation and differentiation. Together with metastasis-associated protein-2, it deacetylates p53 and modulates its effect on cell growth and apoptosis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mouse cardiac mesenchymal stem cells demonstrated that overexpression of the HDAC1 activated cell cycle pathways, promoted proliferation, and induced transcriptional reprogramming, as evidenced by increased pHH3 protein levels and the upregulation of genes including SELP, TUBB6, ACTA2, AURKB, PCNA, and multiple identified hub genes [Zhang et al. DOI:10.3390/biom15050662].