Basic Information

Symbol
HES1
RNA class
mRNA
Alias
Hes Family BHLH Transcription Factor 1 BHLHb39 HES-1 HRY Class B Basic Helix-Loop-Helix Protein 39 Transcription Factor HES-1 Hairy-Like Protein Hairy Homolog FLJ20408 HHL Hairy And Enhancer Of Split 1, (Drosophila) Hairy And Enhancer Of Split 1 Hairy Homolog (Drosophila) BHLHB39 HL
Location (GRCh38)
3:194136142-194138732
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005524.4
Sequence length
1575.0 nt
GC content
0.4997

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-497.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -529.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 412.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005524.4 NCBI
ACACAGGAUCCGGAGCUGGUGCUGAUAACAGCGGAAUCCCCCGUCUACC… 1575 nt 0.4997
Summary

This protein belongs to the basic helix-loop-helix family of transcription factors. It is a transcriptional repressor of genes that require a bHLH protein for their transcription. The protein has a particular type of basic domain that contains a helix interrupting protein that binds to the N-box rather than the canonical E-box. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.