Basic Information

Symbol
HES4
RNA class
mRNA
Alias
Hes Family BHLH Transcription Factor 4 BHLHb42 Class B Basic Helix-Loop-Helix Protein 42 Hairy And Enhancer Of Split 4 Transcription Factor HES-4 BHLH Factor Hes4 HHES4 Hairy And Enhancer Of Split 4 (Drosophila) BHLHB42
Location (GRCh38)
1:998962-1000172
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021170.4
Sequence length
885.0 nt
GC content
0.7379

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-465.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -478.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 177.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142467.2 NCBI
GCGGGCCUGGAGCCGGGAUCCGCCCUAGGGGCUCGGAUCGCCGCGCGCU… 963 nt 0.7456
NM_001410700.1 NCBI
GCGGGCCUGGAGCCGGGAUCCGCCCUAGGGGCUCGGAUCGCCGCGCGCU… 789 nt 0.7554
NM_021170.4 NCBI
GCGGGCCUGGAGCCGGGAUCCGCCCUAGGGGCUCGGAUCGCCGCGCGCU… 885 nt 0.7379
Summary

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in cell differentiation; nervous system development; and regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in chromatin. Predicted to be active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans delineated age-associated mRNA expression patterns in peripheral blood, identifying the HES4 as a differentially expressed gene displaying non-monotonic expression trends with higher levels in the middle-aged group [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373].