Basic Information

Symbol
ABCC4
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily C Member 4 (PEL Blood Group) MOAT-B MOATB MRP4 Multidrug Resistance-Associated Protein 4 Canalicular Multispecific Organic Anion Transporter (ABC Superfamily) BA464I2.1 (ATP-Binding Cassette, Sub-Family C (CFTR/MRP), Member 4) ATP-Binding Cassette Sub-Family C Member 4 Multi-Specific Organic Anion Transporter B MRP/CMOAT-Related ABC Transporter EST170205 ATP-Binding Cassette, Sub-Family C (CFTR/MRP), Member 4 Multispecific Organic Anion Transporter B ATP Binding Cassette Subfamily C Member 4 EC 7.6.2.- EC 7.6.2.2 EC 7.6.2.3
Location (GRCh38)
13:95019835-95301822
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005845.5
Sequence length
5855.0 nt
GC content
0.4258

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1701.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1817.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1538.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001105515.3 NCBI
GCUUCACAGGCUCCAGCCGAGCGGACAGGCGUGGCGGCCGGAGCCCCAG… 3081 nt 0.4460
NM_001301829.2 NCBI
GCUUCACAGGCUCCAGCCGAGCGGACAGGCGUGGCGGCCGGAGCCCCAG… 5714 nt 0.4258
NM_001301830.2 NCBI
GCUUCACAGGCUCCAGCCGAGCGGACAGGCGUGGCGGCCGGAGCCCCAG… 2856 nt 0.4496
NM_005845.5 NCBI
GCUUCACAGGCUCCAGCCGAGCGGACAGGCGUGGCGGCCGGAGCCCCAG… 5855 nt 0.4258
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the MRP subfamily which is involved in multi-drug resistance. This family member plays a role in cellular detoxification as a pump for its substrate, organic anions. It may also function in prostaglandin-mediated cAMP signaling in ciliogenesis. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2014]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.