Basic Information

Symbol
HEXIM2
RNA class
mRNA
Alias
HEXIM P-TEFb Complex Subunit 2 Hexamethylene Bis-Acetamide-Inducible Protein 2 Hexamethylene Bis-Acetamide Inducible 2 Hexamethylene Bisacetamide Inducible 2 Protein HEXIM2 FLJ32384 Hexamethylene-Bis-Acetamide-Inducible Transcript 2 MAQ1 Paralog L3
Location (GRCh38)
17:45160700-45170701
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001303441.2
Sequence length
1436.0 nt
GC content
0.6128

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-589.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -613.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001303436.1 NCBI
CAAUCUUUAAGAAGCUGCUACAGCUAUAAUGUAAGGUUAAGAGUUUAUU… 1923 nt 0.5413
NM_001303437.1 NCBI
CAAUCUUUAAGAAGCUGCUACAGCUAUAAUGUAAGGUUAAGAGUUUAUU… 2376 nt 0.5631
NM_001303438.1 NCBI
CAAUCUUUAAGAAGCUGCUACAGCUAUAAUGUAAGGUUAAGAGUUUAUU… 2228 nt 0.5610
NM_001303439.1 NCBI
CAAUCUUUAAGAAGCUGCUACAGCUAUAAUGUAAGGUUAAGAGUUUAUU… 2380 nt 0.5693
NM_001303440.2 NCBI
CUCUCUUCCCCCCCAUCUUAGUGGCCUGAGCGGCUUGACCAGAGCUGCU… 1288 nt 0.6149
NM_001303441.2 NCBI
CUCUCUUCCCCCCCAUCUUAGUGGCCUGAGCGGCUUGACCAGAGCUGCU… 1436 nt 0.6128
NM_001303442.2 NCBI
CUCUCUUCCCCCCCAUCUUAGUGGCCUGAGCGGCUUGACCAGAGCUGCU… 1196 nt 0.6196
NM_001303443.2 NCBI
CUCUCUUCCCCCCCAUCUUAGUGGCCUGAGCGGCUUGACCAGAGCUGCU… 1344 nt 0.6168
NM_001303444.2 NCBI
CUCUCUUCCCCCCCAUCUUAGUGGCCUGAGCGGCUUGACCAGAGCUGCU… 1199 nt 0.6197
NM_144608.2 NCBI
CAAUCUUUAAGAAGCUGCUACAGCUAUAAUGUAAGGUUAAGAGUUUAUU… 2071 nt 0.5451
Summary

This gene encodes a member of the HEXIM family of proteins. This protein is a component of the 7SK small nuclear ribonucleoprotein. This protein has been found to negatively regulate the kinase activity of the cyclin-dependent kinase P-TEFb, which phosphorylates multiple target proteins to promote transcriptional elongation. This gene is located approximately 7 kb downstream from related family member HEXIM1 on chromosome 17. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2015]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.