Basic Information

Symbol
HEY1
RNA class
mRNA
Alias
Hes Related Family BHLH Transcription Factor With YRPW Motif 1 BHLHb31 HESR1 HRT-1 HERP2 CHF2 HESR-1 CHF-2 Hairy/Enhancer-Of-Split Related With YRPW Motif Protein 1 Hairy/Enhancer-Of-Split Related With YRPW Motif 1 Hairy And Enhancer Of Split-Related Protein 1 Class B Basic Helix-Loop-Helix Protein 31 Cardiovascular Helix-Loop-Helix Factor 2 Hairy-Related Transcription Factor 1 HES-Related Repressor Protein 1 HHRT1 Hes-Related Family BHLH Transcription Factor With YRPW Motif 1 Basic Helix-Loop-Helix Protein OAF1 HES-Related Repressor Protein 2 BHLHB31 NERP2 OAF1 HRT1
Location (GRCh38)
8:79762371-79767857
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012258.4
Sequence length
2197.0 nt
GC content
0.4670

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-656.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -700.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 563.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001040708.2 NCBI
AGUGUGUGCGGAACGCAAGCAGCCGAGAGCGGAGAGGCGCCGCUGUAGU… 2209 nt 0.4667
NM_001282851.2 NCBI
AGUGAAUUCACCACCCCAGCUCUCUGCGGAUUGAGCUAGUGCAUCUUUU… 2035 nt 0.4349
NM_012258.4 NCBI
AGUGUGUGCGGAACGCAAGCAGCCGAGAGCGGAGAGGCGCCGCUGUAGU… 2197 nt 0.4670
Summary

This gene encodes a nuclear protein belonging to the hairy and enhancer of split-related (HESR) family of basic helix-loop-helix (bHLH)-type transcriptional repressors. Expression of this gene is induced by the Notch and c-Jun signal transduction pathways. Two similar and redundant genes in mouse are required for embryonic cardiovascular development, and are also implicated in neurogenesis and somitogenesis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the HEY1 was identified as a high-confidence gene in common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption in postmortem prefrontal cortex [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].