Basic Information

Symbol
HFE
RNA class
mRNA
Alias
Homeostatic Iron Regulator HLA-H HFE1 Hereditary Hemochromatosis Protein High Fe Hereditary Hemochromatosis Protein HLA-H MHC Class I-Like Protein HFE Hemochromatosis TFQTL2 MVCD7 HLAH HH
Location (GRCh38)
6:26087226-26098343
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000410.4
Sequence length
5176.0 nt
GC content
0.4262

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1750.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1842.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1036.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000410.4 NCBI
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NM_001300749.3 NCBI
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NM_001384164.1 NCBI
AGAGCUGGGGAAAUGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCUUCUCCUCCUGA… 4991 nt 0.4260
NM_001406751.1 NCBI
AGAGCUGGGGAAAUGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCUUCUCCUCCUGA… 5167 nt 0.4260
NM_001406752.1 NCBI
AGAGCUGGGGAAAUGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCUUCUCCUCCUGA… 4694 nt 0.4207
NM_139003.3 NCBI
AGAGCUGGGGAAAUGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCUUCUCCUCCUGA… 4858 nt 0.4166
NM_139004.3 NCBI
AGAGCUGGGGAAAUGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCUUCUCCUCCUGA… 4900 nt 0.4173
NM_139006.3 NCBI
AGAGCUGGGGAAAUGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCUUCUCCUCCUGA… 5134 nt 0.4256
NM_139007.3 NCBI
AGAGCUGGGGAAAUGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCUUCUCCUCCUGA… 4912 nt 0.4222
NM_139008.3 NCBI
AGAGCUGGGGAAAUGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCUUCUCCUCCUGA… 4870 nt 0.4216
Showing 1 to 10 of 13 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a membrane protein that is similar to MHC class I-type proteins and associates with beta2-microglobulin (beta2M). It is thought that this protein functions to regulate iron absorption by regulating the interaction of the transferrin receptor with transferrin. The iron storage disorder, hereditary haemochromatosis, is a recessive genetic disorder that results from defects in this gene. [provided by RefSeq, May 2022]

Forensic Context

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