Basic Information

Symbol
HGF
RNA class
mRNA
Alias
Hepatocyte Growth Factor HPTA SF F-TCF HGFB Hepatocyte Growth Factor (Hepapoietin A; Scatter Factor) Fibroblast-Derived Tumor Cytotoxic Factor Lung Fibroblast-Derived Mitogen Hepatopoietin-A Scatter Factor DFNB39 Deafness, Autosomal Recessive 39 Hepatopoietin A EC 3.4.21.7 EC 3.4.21
Location (GRCh38)
7:81699010-81770438
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000601.6
Sequence length
5834.0 nt
GC content
0.3565

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1392.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1518.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1381.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000601.6 NCBI
AGGCACUGACUCCGAACAGGAUUCUUUCACCCAGGCAUCUCCUCCAGAG… 5834 nt 0.3565
NM_001010931.3 NCBI
AGGCACUGACUCCGAACAGGAUUCUUUCACCCAGGCAUCUCCUCCAGAG… 1200 nt 0.4517
NM_001010932.3 NCBI
AGGCACUGACUCCGAACAGGAUUCUUUCACCCAGGCAUCUCCUCCAGAG… 5819 nt 0.3562
NM_001010933.3 NCBI
AGGCACUGACUCCGAACAGGAUUCUUUCACCCAGGCAUCUCCUCCAGAG… 1185 nt 0.4515
NM_001010934.3 NCBI
AGGCACUGACUCCGAACAGGAUUCUUUCACCCAGGCAUCUCCUCCAGAG… 1921 nt 0.3930
Summary

This gene encodes a protein that binds to the hepatocyte growth factor receptor to regulate cell growth, cell motility and morphogenesis in numerous cell and tissue types. Alternative splicing results in multiple transcript variants, at least one of which encodes a preproprotein that is proteolytically processed to generate alpha and beta chains, which form the mature heterodimer. This protein is secreted by mesenchymal cells and acts as a multi-functional cytokine on cells of mainly epithelial origin. This protein also plays a role in angiogenesis, tumorogenesis, and tissue regeneration. Although the encoded protein is a member of the peptidase S1 family of serine proteases, it lacks peptidase activity. Mutations in this gene are associated with nonsyndromic hearing loss. [provided by RefSeq, Nov 2015] CIViC Summary for HGF Gene

Forensic Context

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