Basic Information

Symbol
HHEX
RNA class
mRNA
Alias
Hematopoietically Expressed Homeobox HEX HOX11L-PEN PRHX Hematopoietically-Expressed Homeobox Protein HHEX Proline-Rich Homeodomain Protein Homeobox Protein HEX Homeobox Protein PRH PRH Proline-Rich Homeodomain-Containing Transcription Factor Homeobox, Hematopoietically Expressed HMPH
Location (GRCh38)
10:92689903-92695647
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002729.5
Sequence length
1724.0 nt
GC content
0.4675

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-520.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -556.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002729.5 NCBI
AGCUCUGCGAGGGGCCGGAGCGCGGCGGAGCCAUGCAGUACCCGCACCC… 1724 nt 0.4675
Summary

This gene encodes a member of the homeobox family of transcription factors, many of which are involved in developmental processes. Expression in specific hematopoietic lineages suggests that this protein may play a role in hematopoietic differentiation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the HHEX gene was downregulated in common in spleen leukocytes across all three models of systemic inflammation (trauma/hemorrhage, burn injury, and LPS infusion) at a 2-hour post-injury time point [Brownstein et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00213.2005].