Basic Information

Symbol
HIBCH
RNA class
mRNA
Alias
3-Hydroxyisobutyryl-CoA Hydrolase 3-Hydroxyisobutyryl-Coenzyme A Hydrolase 3-Hydroxyisobutyryl-CoA Hydrolase, Mitochondrial HIB-CoA Hydrolase HIBYL-CoA-H EC 3.1.2.4 Testicular Tissue Protein Li 86 HIBYLCOAH
Location (GRCh38)
2:190189735-190344193
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014362.4
Sequence length
2434.0 nt
GC content
0.3570

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-606.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -654.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 467.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...))))..(((((..((.((((((((((((((...))))((((((..((....))..))))))..(((((.(((((.(..(((.....)))..).))))))))))(((((...((((.(((((((((....((....(((..((((((((((.(((((..(((......))).(((...((((.(((.((((.......((((((.((....))..)))).)).......))))))).))))..))).((((.((.......)).))))..(((((.(((.((.((.....)))))))...)))))((((.......(((((.(((((....((.((((((((.....)))))))).))....)))))))))).......))))..(((.....)))......(((((.(((....))).)))))......(((((..(((...((((.(...(((((....)))))...).))))...)))..))))).((......))((((((((((((.....))))))).)))))))))).))))))))))...)))....)))))))))))..))))...)))))......)))))))))).((.(((((((...(((.(((((((.(((((...(((((.....))))).....((((.(......)))))((((((.........((((.(((((....((((.....)))))))))))))......))))))..((((((.......(((((.(((((..........)))))))))).((((((.....(((.(((.((((((((................)))))))).))))))......)))))).....(((((((((..((...........))..)))))))))))))))..)))))))))))).)))....))))))).)).((((...))))(((((((.((((((..((((((((((((......((((.....))))........(((((((.((((....((.((..(((((((....))))))).)).))(((....))).((((((.(((((((((((..((((.((((((((.......)))))))).))))....(((((.((((..(((((((((((((((.........((((((((.((.((((.(((((((((((((..(((((((((((.......)))))))))))......)))))))))....)))).))))....(((((.((.(((((((...(((((((((((((((...(((((...)))))))).))))))...))))))........))))))).)).))))).))..)))))))).......((((((((((((...............(((((((........(((((...........)))))..........))))))).....(((.(((.(((((.........((((.(((((((((((......))))))))))))))))))))))).)))........))))))))))))...))))))))))))))))))).)))))................(((((.(((.....((((((((((((......((((((..(((((...(((((((((((.(((.(((((.....((((((((((.((.((((.......(((((((((.(((..((((((((((..((((((....))))))...(((((.........)))))..))))))))))..))).)))))....))))........)))))).)))))))))).((((....((((((...))))))..))))))))).))).))))).....)))))).)))....)).)))))))))))))))))).....))).)))))(((....)))..))))))))).............((((..((((((...))))))...)))).....(((.(((((((((......(((........)))......))))))))).))))).)))))).......((((((((...))))))))((((((.......)))))))))).)))))))))))).)))).)))..(((((((.((((.(((.......(((..((((..((((((....))))))))))..)))...((((.((((.......)))).))))....((((((((((.(...........)))))))))))))).))))..)))))))...))))))))))))).((((((.((((((.......)))))).))))))(((((..((((((((((...)))))))))))))))((((((.(((((((((((((((((......)))).))))))...))))))).))))))..((((((((((((.......))))))))))))..........))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...))))..(((((..((.((((((((((,{({...|}}|((((((..((....))..)))))),.{{(((,{((((.(..((({...,)))..).))))))))}}(((((...((((.(((((((((....{{....(((.,((((((((((.(((((..(({......})).(((...((((.(((.((((.......{(((((.((....))..}))).)).......))))))).))))..))).{{{{,((,....,,}|,||||{{(({({.((({(..{....,..))))}|...}}})}|}|...,,{{{(({{{.{{{{{...,{|.{(((((((.....)))))))).))....})})}}}}}},}}.}||||||..(((.....)))......{{{{{.{||,...))},))}}}.,.,,.(((((..(((...((((.{...(((((....)))))...,.))))...)))..))))).{{......},{(((((((((((.....))))))).)))))))))).)))))))))).,.)))....)))))))))))..))))...))))).,....)))))))))).{(.(((((((...(((.(((((((.(((((...(((((.....))))).....(((({(......))))}((((((,,...,.{,{(,,.(((((,...{(((,...,))))))))))))).},,..))))))..((((((.......((((,{(((((..........))))))}))),{(((((.....(((.(((.((((((((...,............)))))))).))))))......)))))).....(((((((((..((...........))..)))))))))))))))..}))))))))))).)))....))))))).)}{((((...))))|{((({{{((((((..{(((((((((((,.....{{((.....}))},,.....,{((((((.{(((..,{((.((.{(((((((....))))))).)}.}}|||....,,,.((((((.{{(((((((((..((((.((((((((.......)))))))).)))),...(((((.{(((..{((((((((((((((........{((((((((.{(.{{({.,,{,{((((((((..(((((((((((.......}))))))))))......)))))))))....)))).,))),,}.(((((.{(.(((((((...(((((((((((((((...(((({...})))))))}}}))))...))))))........))))))).)}.))))).,,..)))))))),......((((((((((((...............(((((((.,{.,...{(({{..,,.......}))}}...,......))))))).....(((.(((.(((((.,........,,,.(((((((((((......))))))))))))}),)))))))).)))........))))))))))))...))))))))))))))}}))}.)))))................(((((.(((.....((((((((((({.....{((((((..,.(((...(((((((((((.(((.(((((.....((((((((((.((.((((|,..,..(((((((((.(((..((((((((((.,({(((,....}))}))...(((((.........)))))..))))))))))..))).))))}..,}))))...,,..,))),)).)))))))))).{{{{....((((((...))))))..)))}))))).})),))))).....)))))).))).....,,)))))))))))))))))).....))).))))){{{....}},..)))))))))...{,,.......((((..((((((...))))))...)))).,||,,,,.{((((((((......(((........)))....,.))))))))},}}})}.))))))...,.,.{(((((((...)))))))},{{{{{.......}}}))})))}.)))))))))))).)))).))}..(((((((.((((.(((.......,,,..((((..((((((....))))))))))..}}|...{(((,((((....,,,)))}.)}}}....(((((((((,.(,,........,)))))))))))))).))))..)))))))...)))))))))))),.((((((.((((((.......)))))).))))))(((((..{(((((((((...))))))))))))))){(((((.(((((((((((((((((......)))).)))))),.,})))))).)))))}..{(((((((((((.......)))))))))))}..........))..)))))

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014362.4 NCBI
GGGCGGGGCUCACGCGAGGCGCUGGAACGGUCCGGGAGAUUCUCGCUCU… 2434 nt 0.3570
NM_198047.3 NCBI
GGGCGGGGCUCACGCGAGGCGCUGGAACGGUCCGGGAGAUUCUCGCUCU… 2400 nt 0.3554
Summary

This gene encodes the enzyme responsible for hydrolysis of both HIBYL-CoA and beta-hydroxypropionyl-CoA. Mutations in this gene have been associated with 3-hyroxyisobutyryl-CoA hydrolase deficiency. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, May 2010]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in post-mortem human blood samples demonstrated that the HIBCH was identified as a protein-coding gene with a negative coefficient in a post-mortem interval (PMI) prediction model, where it was included in a down-regulated expression cluster [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z].