Basic Information

Symbol
HIF1AN
RNA class
mRNA
Alias
Hypoxia Inducible Factor 1 Subunit Alpha Inhibitor FIH1 Hypoxia-Inducible Factor Asparagine Hydroxylase Hypoxia-Inducible Factor 1-Alpha Inhibitor Peptide-Aspartate Beta-Dioxygenase Factor Inhibiting HIF-1 DKFZp762F1811 FLJ20615 FLJ22027 FIH-1 Hypoxia Inducible Factor 1 Alpha Subunit Inhibitor Factor Inhibiting HIF1 EC 1.14.11.30 EC 1.14.11.N4
Location (GRCh38)
10:100529072-100559998
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017902.3
Sequence length
12927.0 nt
GC content
0.4682

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4665.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4902.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3002.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_017902.3 NCBI
GUCCCUGGCGGCGGAGAUGGCGGCGACAGCGGCGGAGGCUGUGGCCUCU… 12927 nt 0.4682
Summary

Enables several functions, including 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity; NF-kappaB binding activity; and transition metal ion binding activity. Involved in negative regulation of Notch signaling pathway and positive regulation of myoblast differentiation. Located in cytosol; nucleoplasm; and perinuclear region of cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the HIF1AN is involved in suppressing ovarian cancer progression via the miR-135b-5p/HIF1AN axis [Huang et al. DOI:10.3390/cells11091381]. A study in mice demonstrated that the degradation of the HIF1AN mRNA in heart tissue was significantly correlated with the 0-48 hour postmortem interval (PMI) [Peng et al. DOI:10.1007/S00414-019-02199-7].