Basic Information

Symbol
HIPK2
RNA class
mRNA
Alias
Homeodomain Interacting Protein Kinase 2 Homeodomain-Interacting Protein Kinase 2 EC 2.7.11.1 HHIPk2 PRO0593
Location (GRCh38)
7:139561570-139777998
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022740.5
Sequence length
15329.0 nt
GC content
0.4983

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-5100.34 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -5377.46 kcal/mol
Frequency: 5.3003e-196
Diversity: 3648.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001113239.3 NCBI
AUGCUGAGCUGAGCCCCGCCGGCCCUGGCCGCGCGCUGCCCCCGGCUCC… 15248 nt 0.4984
NM_022740.5 NCBI
AUGCUGAGCUGAGCCCCGCCGGCCCUGGCCGCGCGCUGCCCCCGGCUCC… 15329 nt 0.4983
Summary

This gene encodes a conserved serine/threonine kinase that is a member of the homeodomain-interacting protein kinase family. The encoded protein interacts with homeodomain transcription factors and many other transcription factors such as p53, and can function as both a corepressor and a coactivator depending on the transcription factor and its subcellular localization. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the HIPK2 is not detected in uninjured skeletal muscle but is time-dependently expressed following contusion, with protein and mRNA levels significantly up-regulated and peaking at 7 days post-injury before declining [Zhang et al. DOI:10.14670/HH-18-072].