Basic Information

Symbol
HIPK3
RNA class
mRNA
Alias
Homeodomain Interacting Protein Kinase 3 DYRK6 FIST3 PKY Homeodomain-Interacting Protein Kinase 3 YAK1 Androgen Receptor-Interacting Nuclear Protein Kinase Fas-Interacting Serine/Threonine-Protein Kinase Homolog Of Protein Kinase YAK1 EC 2.7.11.1 ANPK FIST
Location (GRCh38)
11:33256672-33357023
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005734.5
Sequence length
7614.0 nt
GC content
0.3987

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2086.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2233.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1962.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001048200.3 NCBI
GGUGGCAGCUGCCUCAGUGACGACUGCCGGCAUCGCGGCGACCUGAGGA… 7551 nt 0.3989
NM_001278162.2 NCBI
CUCCGCAGUCCUAGGCCGUAACUACGGAGAUCCCUUUCCUUUCAUUAAG… 7442 nt 0.3893
NM_001278163.2 NCBI
GAUUUCCUAAUCUCCAGGAGGAAAGAAACUAGUCUUUGGGAGUUAAACC… 7123 nt 0.3755
NM_005734.5 NCBI
GGUGGCAGCUGCCUCAGUGACGACUGCCGGCAUCGCGGCGACCUGAGGA… 7614 nt 0.3987
Summary

Enables protein serine/threonine kinase activity. Involved in mRNA transcription; negative regulation of apoptotic process; and protein phosphorylation. Located in cytosol; nuclear body; and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human and mouse cells demonstrated that the HIPK3 is an abundant, stable, and conserved exonic circular RNA (ecircRNA) produced from the second exon of the HIPK3 gene, with its circular form being approximately fivefold more abundant than the linear mRNA and showing cytoplasmic localization [Jeck et al. DOI:10.1261/rna.035667.112]. Further research in human diseases indicates that the HIPK3 promotes epithelial-mesenchymal transition in cervical cancer via the miR-338-3p/HIF-1α axis and decreases oxidative stress-induced dysfunction in cardiac microvascular endothelial cells via the miR-29a/IGF-1 axis [Huang et al. DOI:10.3390/cells11091381].