Basic Information

Symbol
HIVEP3
RNA class
mRNA
Alias
HIVEP Zinc Finger 3 KBP-1 KBP1 ZAS3 KRC Schnurri-3 KIAA1555 ZNF40C SHN3 Kappa-B And V(D)J Recombination Signal Sequences-Binding Protein Human Immunodeficiency Virus Type I Enhancer-Binding Protein 3 Human Immunodeficiency Virus Type I Enhancer Binding Protein 3 Transcription Factor HIVEP3 Zinc Finger Protein ZAS3 Kappa-Binding Protein 1 FLJ16752 Kappabinding Protein-1 ZAS Family, Member 3
Location (GRCh38)
1:41506365-42035925
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024503.5
Sequence length
12617.0 nt
GC content
0.5609

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4510.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4721.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2885.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((...((((..((.((((((((...(((((((((((((..(((((........(((....(((..((((((.(((..((((((..............)))))).))).........(((((.....((((((....(((((((..((((.......)))))))))))...))))))((((((..(((.((((((((.(((....))).).....)))).(((((((((.((((((((.(.(((((..((((......))))..)))))...(.(((((((((((((((...((..((.(((....))).))..)).))))))))))))))).)...(((((((.(((((....(((((((((((........))))).))))))....))))).)))))))...........(((.((...)).)))....(((.....)))).))))))))..)))))..))))......))).)))....))))))..(((((...))))))))))..)))))).)))...)))..........)))))...((((((.(((.(((((((....))))))))))))))))..(((((............)))))..(((((.(((((((((((((....(((((((((((..(((..((((.(((((..((((..........)))).))).)).)))).)))))))((((((..((((((((((((((...((((((.(..(.(((.(((((((((((((((......((((..((((......))))(((((((((..((((((((..((..(((((.....))))...)..))...))))))))((((((..((((((((((..(.((((((.....)))))).).....))))).))))).((((((....((((((........((..((((.(((...))).))))..))...((((.((....)).))))(((((..((........)).))))).....)))))).))))))..((((.......))))...((((((((((((((....))))))))))))))...(((((((((((((((.((.......))...)))).))))))......))))).(((((.((((.......))))..))))).........(((((.......)))))..)))))).))).)))))).))))..)))))))))))))))...(((((((((((.((((((....)).......(((((.((((.((((.(((((...((((.(((......(((((..(((........)))..)))))(((((...)))))..)))..)))))))))))))...))..))))))).....((((((.((...........)).)))))))))).))))))......((((((......))))))......(((((((...((((((((((....((...)).((((.....))))........))))))).)))..)))))))))))).....(((((.....................)))))......(((((..................)))))))).)..).))))))..))))))))))))))(((.((....)).).))..))))))..((((((.((..(....)..)).)))))).........)))))))..)))))))))))))...)))))........)))))))))))))...))).....)))))...)).)))).....)))).(.((((((..(((((...((((((((.(((((((.(((((((((((.((((..((((......).)))...))))..((.(((((((.....((.(((((((.(((((........)))))(((...((((((((((.((((((((.(((((.....))))).....(((((......))))).(((((.......).)))).))).)))))..............((((....))))....)))))))..)))...))).....((......))..))))))).))((((((((((((.((((((.....((((((((((((((.(((((((.....(((((.......(((((((......(((((((...((((((((.(((..(((((((..((.(......(((((......((((...((((.((((((....((((....((((((((..(((((((((...((.(((((((((((.((((.......))))((((....(((...)))..))))...((((((..(((((...((.(((.((((....)))).((((((((.((.((((..((..((((.....(((....................)))....))))(((((((....))).)))).))..)))).))))))))..)).(((((((....)))).)))...))).))..)))))))))))....((((((...)))))).((.((((((.(((....................((((((((....((((......((((.((...((((((((((((.((((((((........)))))..(((.(((((....(((......)))....(((((.....(((((((((((...))).))..)))))).......)))))..((((((.((((..........))))))))))......((((..(((((((....(((.((((...((((.(((..((...(((((..((((((((...((....((((...((..((((..................))))..))))))...)).))))))))...........(((....))).(((((......))))).)))))..))..))).....))))...)))))))(((((.((.....)).)))))......(((.......)))....)))))))..)))).))))).)))........((((....))))..(((.((.(((((.((((((...((.(((...(((((..(((((((....(((.(((((..((....))))))).))).........)))))))..)))))...(((((((.((.(((.....((............))..))).)))))))))....(((((((((..((.(((....))).))....(((((......)))))...........))))..)))))............(((((.(((..(((................)))..))))))))......))).)))))))).))))).)))))....((.(..(((((.(((((((..(.((((((....(((((..(((.(((.(.(((.((..(.((((((((((((..((........))...)))).)))))..((((((((.(((..((.(((.((.((((....(((.(((((..(((((..((((((..(((..(((((.((((.(........).))))...)))))..(((((((((.((..(((((((((((((...((((((.((((.(((((......(((................)))....)))))..))))....(((..(((......)))..)))...))))))...)))))((((((((((((((((.(((........)))..(((....))).................)))))))......)))))))))..)))))))))).))))))))).(((((........))))))))....))))..))..)))))......((....))..))))).))).))))))((.((((...((((((((...(((......((((((((((.((..........)).))))))))))..)))))))).)))....)).)).)).((....))..))).))......)))))))))))..))).)..)).))).).))).)))...)))))....((((((..((((..(((((.(((((.((.(((((.((((((.(((((((......((.(((((((.((.......)).)))))))))...))))))).........))))))...))))).)))))))...))))).))))..))))))...(((.(((((((((.....((((...((....)).))))))))))).)).)))................((((((......((.((.(((....))).)).))......)))))).)))))).)..)))..)))))))))..).)).........))).)))).))))))))..))))))....)))).........)))).)))).(((((((...)))))))))).))))))..))....)))))))..)))).))..)))).)))))..))))))))....)))))))))).))))..(((.((((...((((((((((((........)))))))((((((((..(((..(((((..((((....................(((........)))......)))).))))).((((.....)))).(((((((......))))).)))))))).)))))((((...(((..((...((((((....))))))..(((((.....))))).((((((...))))))...))..)))...)))).......)))))..)))).)))....))))....)))))....)))..))))))).))).)))).)))).(((((((..(((((((.....((((...))))......((((........)))).))))))).......)).))))).....))))))).))))))).......)))))))))))).))))))))))).)))((((....)))).......)))))).))..))))))))))......(((.............)))..........))))))).)).........((((..(((((((..(((....((((((((((((.(((((((.(((((.....((((((.(.((((.((((((((.(((...((.....)).))).)))...)))))(((((((.....)))..))))..(((((((........))))))).))))...).)))).))..(((((.....(((.((....)))))(((((((((((((((((.........(((((..(((((..((((.(((((((((...(((((((((...((((((((.(((........))).......(((..(((....)))..)))(((((((.......((((((((.(((((......(((.(((.((..((...))..)).))).)))..))))))))).)))).((((......))))....((((((...)))))).)))))))(((((((((...(((((....))))).......((((...((((.((((((.....(((.(((((..((((((((....................))))))))..(((.((.((((((((.......(((.(((((((((.((.......(((((((((.((....)).)))).......(((((...((.((.......)).))....)))))...........((((.(((((.(((((.((((...(((((((.....((((.((((((((.(((((.....)))))..))))))))..))))..(((((..............)))))....(((.......))).(((((((..(((((.......))..)))..)))).)))......)))))).).....))))...)))))))))).))))))))).((((((....))))))...((.((((((..........(((...)))((((....))))((..((((......))))..))......)))))).))..(((......)))..(((.....))))).)))))))))..)))........))))))))....)).)))............(((.......)))......))))).)))......)))))).)))).)))))))))))))..)))))))).((((((.((((...........))))))))))..........((.(((((..(((((..((....)))))))....))))).))(((((......)))))..((((........))))(((((((((....((((((.(.(((....).)).).))))))..))))......)))))..))))))))).....((...))...))).)))))).))))..).)))).((.((((((((.......))........(((((.((((.((((.((..((((((((...(((.(((....))).)))....)))....))))).)).)))).)))).)))))(((((((((...)))).))))).......)))))).))(((((((....)))))))..)))))(((((.((((.((.....)).)).)).)))))..(((....))).((((....(((((.(((.((.(((((((....(((......))).(((....)))..........))))))))).))).)))))....))))..((((((.......((((..((.(((((......))))).))..))))...))))))...(((...(((..((........)))))....)))..))))))).)))))))))).))))).....(((((..((....))..)))))....((((......)))).))))))))))))...)))))))).))))....)))..)).))))).))))..........))))))))..))))))))))))))))))..)).)))...)))))).)....)))))))))(((((((((((((....)))))((....))....((((((.((((.((...((((.......))))...)).)))).))).)))....(((((((...)))))))....((((((......))))))...(((((((((..((((...(((....)))...))))((((((((((..((((((.....)))))).(((.((((.......(((((..((((.....((((((((((.(((.....)))...))))))))))........(((...(((..((..((......)).))..))))))..)))).)))))(((.....(((((.......................))))))))...)))))))((((.(((((((....(((((((.((((.(((((((.......))..)))))...)))).)))).)))....))))))).)))).....((((((.(((..(((((..(((((((((..(((((..(((..((((.((((((((.................))))))))..........))))..))))))))...((((((.(((.(((((...))))).)))..)).))))((((((...((((....))))...(((((((((((...((((..((((((((((((.((((((((((.(..((((..((((((((((.(((......(((.......)))((.((((..............(((((..(((.(..((((((.(((.(((((...((((((((((.(((((((((...((......))..)))).((((((((((((..(((((((((((((.......(((((((((((((.((((.((((((((...(((((((((((...(((((.....))))).(((.((((((.((((((((((((((((.((((((.((.....((((((((((....))))).)))))...(.(((((..((((((((((((............))))..))).))))))))))).)).))))))))).))).....)))))).)))).)....).))))))))))))....))))))....))))).))))))).(((.(((.(((....)))))).)))..((((.......)))).............((((....)))).))))))))))))).........)))).)))))))))..))))).)).)))))..))))).)))..........)))))))..((((.....(((((.((...............))..))))).....))))......(((((.(((..((....))..)))))))))))))))))))).))..).))).)))))...)))).)).....))).))))))))))...)))))))).)))))))...((((.....))))))))))))))))...))))...))))))))))).....(((.(((....))))))(((((((((.(..((((((.((.((((((....((....))....)))))).)).((......))......))))).)..).))))))))).......(((((((.(((((((.((((...(((.((((...)))))))..))))..((((..((((((((...(((((((..................(((..........((((.....)))).......)))......((((((........((((((((((....)))................(((((((.(((...))).)))))))...........)))))))...........)))))).....))))))).....))))).)))..))))......))))))).)))))))))))))((((((.((.........(((((.....))))).........)))))))))))))))))..))))).)))))))))...........((((..((((.....((((........)))).....))))...))))..(((((((((.(((....(((.((((((.((((.(((...((((.(((((..(((...)))(((.(((.((((....)))).)))...)))......))))).)))).......(((((((((....(((((((((((((......)))(((...(((........)))...)))((((((((((((((((((((((((((.(((((...........)))))...(((((((((((((........(((((((((...........((((((((......(((((((((((....((((.(((..((((((((((((((.((((........))))))))).(((((((((.....((((....((...(((((((((((((..((.(((((((((((((((...)))))))))..((((((..(((.....)))...)))))).........(((((((((..((......))..)))))........(((((((..((((..(((((...(((.((..((.(((((((....))))).)).))..))))).....)))))))))))))))).........))))..)))))).))))))))((((((((((...((((..((((((..(((((((((...((((....)))))))))))))....)))))).....))))..(((.....)))....(.(((((((.(((((((...........((......))...(((((((((((((((...((((((((((((.(((((........((((((((((...)))))))))).(((((.(((..........))).)))))((((....))))......(((((.........)))))......(((((....)))))))))).))).))...)))).)))...)))...........(((.......))).((((((((.(......((((((.....(((........)))........((..(((....(((((........)))))...)))..)).((((........))))))))))(((((((((((.....))))))))))).....((((......))))..............).))))))))..(((((((((((..(((((((((((.(((((((......((((((((.........)))).......)))).....))))))).))).((((((.(((((..(((((.((((......)))).)))))..)))....)).))))))(((((((.(((.....)))((((((((....))))))))........)))))))(((((.......)))))........)).))))))...)))..)))))))).............))))))))))))..((((((.((.((((......((......))......)))).))))).)))...........)))))))..)))))))).((((((.(((.......)))))))))....)))))).))))((((((((....(((((.((((((((((((((....((((((((((...........))).))).......(((((.(((((......)))))....)))))((((((((.(.((((.(((((((((((((........)))))..((((((.....((....))......))))))......((((.(((((((.(((..((((((((...(((.(((((((((((.((.......((((....((((..((((((((.((....))))))))))))))...)))))))))))))))........((((...((((....(((((.....((((((.((....)).))))))....))))).....))))...))))......((((....))))..........((((......))))......))))).))))))))))).)))))))))))(((........)))....(((((((((((((((((((.((((..((((.((((.(((((.(((((((.(((....(((((..((((((...((((..........((((.((((((((...((......................))))))))))))))((.((.((((((((...((((..(((...((.....))...)))...)))).)))))))).)))).......))))....)))))).)))))))).)))))).)...)))))....(((....)))....(((((.....)))))...))))...))))..)).))))).......))))).)))))))))))...)))))))).(((((.....))))).)))).).)))))))).))))))))))))))))))..)))))....))))))))..((((....))))......))).)))).))...)))).)))))))))...((..((..(((.......)))..))..))(((((((((((((((((((((((((((((.((((((((.......))))))))))...)))))))...)))))((..((((((..((.((((...((((((..........))).)))...)))))).))))))..))..))))))).............)))))))))))))))))..)))))))((.........)).....)))))))))))......)))))))))))))))))...((........))((((((.....((..((((......))))..)).....))))))......(((...(((((........)))))...)))....(((((.(((((....(((.....)))....)))))))))).......((((..((((((.(((..((......))..))).))))))..))))(((((..(((..(((..(((((...((..((((((((...(((.((.((....)).))..)))..))))))))..)).)))))..)))))).))))).))))))).))))))..........((((.((....(((...)))..)).))))....................))))))))))))))))))))))))))..((((...((((((.(((((((((.((((...)))).(((.....)))............(((((((.....))))))).(((((((...)))))))...)))))))))....))))))...))))..((((......))))........(((((.........)))))((....)).))))).)))))....)))))))))...............(((....(((((.(((((...))))))).)))..)))........)))))))...........)))))).))).........................(((.(((((....(((((.(((((((.(((............))))))).)))..)))))..))))).))).....))).)))))))))((((((.........))))))....((((((......))))))..)))))))))).)))))))))))))))))(((((((.......)))))))....(((((((................))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((({(((.{.((({..{,.((((((((.,.(((((((((((((,.(((((.....,,,(((,...(((..((((((,(((..((((((..........,...)))))).))).}.......(((((,....((((((....(((((((..{{((.......)}}})))))))...))))))((((((..(((.((((((((.(((....))).}.....)))).(((((((((.((((((((.(((,{((..((((......))))..||}||..{(.(((((((((((((((...((..((.(({....})).))..)).))))))))))))))),}...(((((((.(((((.,,.(((((((((((........))))).)))))).,,.))))).)))))))...{{,.....,,,,||..,))}))},....||....,,.)))))))))))..)))))..))))......))).)))....))))))..{((((...))))))))))..}))))).)))...)))..,,|.....)))))...((((((.(((.(((((((....))))))))))))))))..(((((............)))))..(((((.(((((((((((((....(((((((.(((,..((..,((({((,,,..||||}}....||,,|}}|.|||.|}.}}}}.})||||.,{(({(..((((((((((((((.,.((((((.(..{.(({.{{{{{{{{{(((({{,{{,,{(,(({,((((..,...}}}){{{{({(((.,((((((((..((..{((((.....))))...)..))...))))))))|{||||..((((((((((.,(.((((((.....)))))).).,...))))).)))))...(((({,,.{{{||,||,,....,,..((((.(((...))).)))),{||{{,{(((((({,..|{{||..(((((..((........)).)))))....,{{,..,.,}}}||.,{{,....,}.,,},,.,,{{|{{{{{{{{(((,,,,}||||||||}}}}|,,.,||{{((((((((((.((.......))...))))})}))))......}}|||.,{{{|,,.|||,,.,..,))),.}}}}},........,(((({,,,...,}))}},)))}}}.}}|,|||}||,.|||..})))})))))))))}...{{{{{((((((.((((({....,,.......((((((((((.((((.(((((...((((.(((,....{(((((..(((........)))..)))))|{{{|..,))),},.}))..)))))))))))))...))..)))))))......,(((((({,{{,......,))))))))))))).))))))......((((((......))))))......(((((((...((((((((((....(,...|..((((.....))))..,.....))))))).)))..)))))))})))),,,,,|{|||,},.||.,..},.........))))),,....||{||,,,.,,,,.......,,.)))))))}.}.,),)))))).,))))))))))))))|||,||,...)).}.})..)))}}}|.((((((.((..(....)..)).)))))).,..}.}}.)))))))..)))))))))))))...))))).....,,,,))))))))))))...))).....)))))...},.}}|}.....}))).{.((((((..(((((...((((((((.(((((({,(((((((((((.,(((,.((((......).)))...,..((((((({{{{((({.{{(..(((.(((.(((((........)))))...))))))((((((,..(((,,{{.(((((.....)))))....}||,,,.}}}}}),,,}.(((((.......).)))).))).)))))}}}}}}}.......((((....))))....|||,|||{{{.....((({....((......)).(({{(((....((((((((((((.((((((.....{{{(((((((((((.(((((((.....(((((..,,,..(((((((......(((((((...((((((((.(((..((((((({,{(,(,,....|}))}),,.{,(((({(.((((.((((((....((((....((((((((..(((((((((.,.((.(((((((((((.((((.......))))((((....(((...}})..))))...((((((..(((({..,((,(({.((({....})))...((((((.((.((((..((..((((.....(((.............,......}}}....))))(((((((....))).)))).}}..)))).))))))))..{{{.,,{{{|.|,,,}}},.,}...))).)).,)))))))))))....((((((...)))))).((.((((((.(((....................((((((((....((((.,....(({{{((...((((((((((((.(((.((((....((..((((,...((.((((((...,,{{..{{{,{{{...,((((.....((((({(((({...})).))..}))))).......))))},,((((((.((((..........)))))))))).{{{(((((((.((((((({{..(({.((((...((((,({(..((...(((((.{(({{{(((.,{(({{{{(,{({.{(({.,........,,,,,,,{,....||||,...,,},..}))}}}})}))}...........||.....})},||(((.,....))))}.}}}}}..}}..,}}.....)))),,.)))))))||{,||{{|||.,}),}}}))|,.|||||{,.....,}},....}}}}|||{{({{..{|(({(({{.,{{{((.(,({,,,,,.||..|((,({.({,((.{{{,||..,,|.|||,..(((((,.(((((((....{{(,(((((..((....))))))}.))).........))))))).}))))).{,(((((((.((.(((.....((.,..........))..))).))))))))),,..||||,,,{{,,||.,{{..,,))),))....{((((......))))).........,}))))}.}}}|}....||,.....(((((.(((,,{{,................}}),.))))))))......,}..,})))}}).))))),}},}),...(,{(((((((((((((.........,{{,..{.{((((..(((.(((.{.{((.((.,(.((((((((((((..{{........},...)))),,))))..((((((((.(((,.((.{{{.,|.||||{,..{{{.,({((..(((((..((((((,.(((..(((((.{(((.(........}.)))}...)))))..(((((((({,({..(((((((((((((..,((((((.((((.{{{{{......{{.,,...........,.||||,,,,}}}}),,))}}.,,.|(({,,,,,}}}..)))}}}},...}}})))..,))))){(((((((((({{(((.(((,.......||}..,{{....}}},,....,,|,......,))))))).,,...})))))))),.)))))))),}.))))))))).{((((........)))))))).,..})))..})..))))}...,,,,,....)).,))))|.)))..}})}},{,{||,..||||({({{,,.{{|......((((((((((.((..........)).))))))))))..))|}))}}...},}}},),))}},,|,,...))..|||.||....}}})))))))))}..))).}..)).))).}.))).)))...)))))..,{(((....))))|,.{{({.....,..},))},}|))))||)))))))))}.....,,.{((((((.({.......)).))))))){|{.{(((.((((.....)))).))))...))).,,})))}}|||||||}},}},))))}}}))))))}},}}(((((((.....((((...((....)).))))))))))).,,.{{{{{{.{,{{,,......})))|.....}}||}||.(((....))).}}.,.......})}.,),)}).,),))))))..)).},..))))..)).....))))))).)))).))))))))..))))))..,.)))).........)))).)))).(((((((...)))))))))).))))))..))....)))))))}.}))).))..))))))))))..))))))))....)))))))))).)))).,((({({|,...|||||||||||{||||||.,}||||||{({,{{{,.,(((..,((,(((({({{..,........,.}}}.}}|,|,...,,},,}}......|}}}.,,|,|.||||,,,.,)))),||(((((......))))).}}...|||{||{,.(((,...(((((((...((((((....))))))..(((((.....))))).,(((((...})))}}...,|..,,,..,)},}.|,,....})))|||,},.,,,...}))))}}...)}.)))))))...}}}}}}}.})).}))).)))).((((({(..{((((((.....(((,...,)))......{(((........)))).))))))).......)),})))).....))))))).))))))).,,,...)))))))))))).))))))))))).})}{(((....)))).......)))))).)),.))))))))))...)))))).............)))}.....)))))),,,,......,,.....((((,.(((((((..(((....((((((((((((.(((((((.(({((,..{(((..{((({({(((((((((((.(((...((.....)).))).))),..}))))(((((((.....)))..))))..(((((((........))))))).,.{(,(,...,)),}.{{((((,..{,,((({((,{,{|,|,|((,((,((((,((((,({{{{..{((({(({..(((({.,((((.((((({{{{...(((((((((...((((((((.{{(........}}),,.....{{(,,({,..,,)}}{{|||,{{{,{{{{{{...{(((((((.(((((......(((.{{{.{{,.{{...}}..))}})).}}}..))))))))).)))}.((((......)))).,.,,.||,,}}}))},}..}})))..(((((((((,..(((((....))))}.......((((...((((.((((((.....(((.(((((,.((((((((....................))))))))..(((.((.((((((((.{{..{.(((.(((((((((.((,,,,...{(((((((,,((....||,||||{{{{..,(((,{.,{(({,(..,,..{||{||....,,,||,{.......{.((((.(((((.(((((.((((...(((((((.....,{{{.((((((((.(((((.....)))))..))))))))..}|||{.(((({.....,........})}}}||,.||{......,))).{((({((..({(((.......))).)))..)))))))),.....)))))).).....))))...)))))))))).)))))))))..,||,|}}}}),,,)}..,,|}|||,,,.}}}}.}}}}||,.,.},,||,({{...,))|,..((((......))))}}),.})}}.))),,,.)),.,,.......,||..{({.....))))).)))))))))..)))......}}))))))))....)).)))....,{{.....|||.......}}}......))))).)))......)))))).)))).)))))))))))))..)))))))).{{((((,{{((,,,........},}}}}}))}.,........((.(((((..(((({.,((....)))))))....))))).))(((((......))))).,((((........))))|||{{((((....((((((.(.(((....).)).).))))))..))))......}})))..))))))))),,...((,,,}|.,,|||,||||||.,|||..}.))}}{((.((((((.{..{((.{........}.}}||{.((((.((((.,,..(((({{(,...(((.(((....))).)))...,,)),)),}...)})).)))).)}})))))).))))}}}||,,|}||}|}|||{{,,.,,,}))))},)){((((({....}))))))..))}})||,,,..||,..,}}.}})),))}),.,))))}}||,.}}})).}.|||....(((((.(((.((.(((((((.{{{(((({.....,,.,,})}.}),),,........))))))))).))).))))).,{{||||,{(((({{..,,...((((..((.(((({......))))).))..)))),..))))))}.,)}}}..||}},,,.,......}}))}..,.})))))))))))))))))))))),})}}),....(((((..((....))..))))).,,,{|{{,,,,..)))).))))))))))))...)))))))).))))....)))..))}))))}.))))..,}},....))))))))..))))))))))))))))))..)).)))...)))))).}.,..)))))))))(((((((((((((....)))))((....))....((((((.((((.((...{,,.{{{,...})))...)).)))).))).)))....(((((((...)))))))....((((((......))))))...(((((((((..,,(({{{((,{{{{|||{{{||,,,((((((((,..({{(({,,{{{{,.,,,.)))}||)))||}}}}}}}}|.|}|||}}...((((((((((.(((.....)))...)))))))))).....,..,.,..||||,.|,..((......||.||{,|,,|,,..,..}||||}.||........}}}....{{{{{{..((({(((((((((.{.,(({,,..,},..((({.(((((((....(((((((.((((.(((((((.......))..)))))...)))).)))).)))....))))))).})))..{(((.......)))}{{{{{..(((((((((..(((((..(((..((((.((((((((.....,...........))))))))..........))))..))))))))..{((((((.(((.(((((...))))).)))..)),})))},,{({,,,((((,...}}}|,..(((((((((((...((((..((((((((((((.,(((((({((.(..((((..((((((((((.(((.....{(((.......)))|,.((((,.............(((((..(((.(..((((((.(({{(((((...((((((((((.(((((((((,..{,.,....}}..)))}.((((((((((((..(((((((((((((.......(((((((((((((.((({{((((((((...(((((((({((.,,(((((,....}}}}}.({{.{{|{||,|||{{{{{{{{({,,.,{,((((.((,{{.{(((,{({({,{{({|,,,,,))))}.,}}.,({(({.{{(((((,,((({(,,,{{...{{||,|{{||,.||,,,,,))))})).,)))),,))))))}},}})))}}},)))},}....),)))))))})))).,,.))))))..,.))))).))))))).(((.(((.(((....)))))).)))..((({{.||...,||,.............{{{{,,.,))}),))))))))))))).........)))).)))))))))..))))).))))})))..))))).)))...,,....,)))))))..((((,....(((((.((..........,....))..))))).....}}})......(({{{{(((..((....))..)))))))))))))))))))).))..}.))).)))))...,))),),.....))).))))))))))...)))))))).))))))}...(({{.....}))}))))))))))))...))))...)))))))))))....,(((.(((....))))))(((((((((.(..((((((.((.((((((....((....))....)))))),)}.((,....,))......))))).)..).))))))))).......(((((((.(((((({.((((...(((.((((...)))))))..)))}..{(((..((((((((.,.(((((((..................(((......{...((((.....)))),......)))......((((((........(((((((,{{....,||{,..........,,..{((((({.(({...))).,)))))}.......,...))))))}...........)))))).....)))))))...}.))))).)))..)))}..,,..})))))).)))))))))))).(((((,|((.........(((((.....))))).........)))))))))))))))))..})))).}).))).)))))}.......{(((..(({{.....,(((,.......,))),..,,||}}...))))..(((((((((,{{{...,(({.((((({.{{{,.,{{...{(((.(((((..(({...}))(((.(((.((((....)))).)))...)))......))))).)))).......(((((((((..,,((({{(((((((({{....)),.}}},.,{{........,||||||.{((((((((((((((((((((((((((,((,,,,,....,,,..,,,}},,.(((((((((((((.......(((((({(((((((((((((((((((((((....((((((((((((......(((.((((((((...(((((((.((((........))))))))).((.....,..,,......,},,.)))}}))))))).....,,,......,.(((((((((...))))))))).)))))))))(((.....)))...(((((((..(((((.(((((((((..((......})..)))))...,{...(((((({.{((((..(((((,..(((.{{..((.(((((((....))))).)).))..}})))..,..))))))))))))))))...},....))))...)))))....))))))).,.........(((((((((.....(((((((((.{{((,...,,})),)))))))))...((((.(((....{{{.((((,,{(........}),,)))).....((.(((((((.({{,,(,......,,....})}.)).))))))).))))).))).))))...,.((((..(((((((((((((......)))))))).)))))..))))....))))))))).(({,(((({(((,{....,||||||||,||,.,,{,.......,.{{|||,,,,)))))}).}}}).)}).)))))))).)))))))))).,...,.,,|.,..,....}||||}}||||})))}},..{(((((.....{{{.....,,.,}}........{(..(((....(((((........))))}...)))..)}.((((........)))))}}}}}(((((((((((....,}))))))))))......(({((((((((.{({,((((...(((.((((((.((((.(((((((.{(((((((((...(((.(((((((..,...((((((((.........)))).......))))..}..))))))).)))((.((((((.{{{..(((((.((((......)))).)))))..,},....((((.(((((((((((..,,,,.(((((((((((((....)))))))...,.,..,,({({(((((((((.{({.,.............(((((.(((..(((.(((((....))))).)))..}}}...)))))})}.)))))}|}},,))).}}}}}}|||...((((((.,.(((,((......)}.,)).....})))))...((((((((((.,(((({{{(({,,...|.))))))))).,,(((((,.{((((((((((((,{((((((((((((({.,.,{{{{.{.{{.((((({{,.,.{({.....)))..,.}}..)))))}))))||....(((((((({......)))))))))|{{{,...{,,,{{,.{{,{,{{.{{{{{{{,{,((..((((({.....{{....}),.....|||||}..}}|.|)))})}.,}}}.))},}))}},}}}}..))))||(((((((((.{{..,...,((((....((({..((((((({,((....))))))))))))))..,))))))))))))))).}...,.})))).))))))))},|},||}.})))||||))|...,(((({({,,.}}}.))))).....))))}))))))))))..((((....)))).........))))))))))).)))).......((((.((......)).)))))))))).))...{,{((((((((..(((((((((((((((((((.((((..((((.((((.(((((.{((((((.(((....(((((..((((((.,,((((..........{{{(,{(((((({...{{.......,............||}}}})))}}}}}}}{{.((.((((((((...((((..(((...((.....))...)))...)))).)))))))).))}}..,,,,,),,))))})))))).)))))))).)))))).}...)))))....(((....)))....(((((.....)))))...))))...))))..)).))))).......))))),}))))))))))....(((((...(((((.....)))))...))))){{,,{.((((..({...(((,{((((.(((((((((((((((......((({....}))),))}}|{|||...,,.,...,||,|{((((((((.......((..(((.......)))..)).{((((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((.......))))))))))...)))))))...))))...)))))).)))))))).))}.((((((..........)))},))....))))))))}|{||,...}}}}..)))))))))))))))}}..))))..)})))........,(((((,....{(((........)))))))))).{|((||...}))),)))))))))}))))).,.,,,......},,...))))..}.))))))).)))).)))))).)))...))))..,}}})))))))).))).,||....}},.|,,..(((({,(((((....(((.....)))....)))))))))).......((((..((((((.(((..((......))..))).))))))..)))){((({..,{,..(((..(((((...((..((((((((...(((.((.((....)).)).,}))..))))))))..)).)))))..))).,,.))))).))))))).)))))),}...,....{{{{.{|,...(((...}))..},.,})),,,.,,,......,,,,,,.))))))))))))))))))))))))))}.,|||,,.{{{{{{{((((((((({(((....((((..,,....})))......}}}}}}||||{{{,....}}}}|,|||||||{|||||||||||..,|||||}||{{{,.||}}}}}}.}}}}..,,,|},},,.}}},........||||{,,,,,,,,,)))))||....)).))))).))))),...)))))))))...............{{{....((({(.(((({...}))))})}}))..))).....,..}))))},...........}})))).}}}........................,(((,(((((....(((({,({{((((,((,............))))))).,))..)))))..))))),)))}},..,,}.))))))))),,,,,|}}})..))))))....,,.{(((((......)))))})})))))))))).))))))))))))))))).{(((((......,)))},......(((((((................))))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001127714.3 NCBI
GGUCUGGACUCCUAGUGGAAAAGACAAGCGAGGCAUGGGUUGGCUCUGG… 12534 nt 0.5612
NM_024503.5 NCBI
GGUCUGGACUCCUAGUGGAAAAGACAAGCGAGGCAUGGGUUGGCUCUGG… 12617 nt 0.5609
Summary

This gene encodes a member of the human immunodeficiency virus type 1 enhancer-binding protein family. Members of this protein family contain multiple zinc finger and acid-rich (ZAS) domains and serine-threonine rich regions. This protein acts as a transcription factor and is able to regulate nuclear factor kappaB-mediated transcription by binding the kappaB motif in target genes. This protein also binds the recombination signal sequence that flanks the V, D, and J regions of immunoglobulin and T-cell receptors. Alternate splicing results in both coding and non-coding transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A review of RNA-Seq studies in post-mortem human brains notes that the HIVEP3 was identified as a differentially expressed gene in the hippocampus of individuals with cocaine addiction and alcoholism compared to non-psychiatric controls, representing a shared neuronal function-associated molecular change in addiction [Wu et al. DOI:10.1111/Pcn.12550].