Basic Information

Symbol
AMIGO1
RNA class
mRNA
Alias
Adhesion Molecule With Ig Like Domain 1 AMIGO KIAA1163 Amphoterin-Induced Protein 1 Alivin-2 AMIGO-1 ALI2 Amphoterin-Induced Gene And Open Reading Frame Amphoterin-Induced Gene And ORF
Location (GRCh38)
1:109504178-109509738
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020703.4
Sequence length
5130.0 nt
GC content
0.5220

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1822.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1919.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1586.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_020703.4 NCBI
GCUCGCUGCCCCCACGCCGCUCCCUCCGCUGGGAUCGCUGCGCCUCCGG… 5130 nt 0.5220
Summary

Predicted to enable potassium channel regulator activity. Predicted to be involved in several processes, including heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; nervous system development; and positive regulation of nervous system development. Predicted to be located in dendrite; neuronal cell body membrane; and voltage-gated potassium channel complex. Predicted to be active in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans delineated age-associated mRNA expression patterns in peripheral blood and established a robust age prediction model using 34 mRNA markers, including the AMIGO1 which was identified for the first time as an age-related gene and plays an important role in neurodegenerative diseases [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373].