Basic Information

Symbol
HMOX2
RNA class
mRNA
Alias
Heme Oxygenase 2 HO-2 Heme Oxygenase (Decycling) 2 EC 1.14.14.18 EC 1.14.99.3 HO2
Location (GRCh38)
16:4474246-4510352
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002134.4
Sequence length
1673.0 nt
GC content
0.5714

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-646.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -673.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 391.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001127204.2 NCBI
GCUGGGCUGCAGGGACUGCGGCGCCUGAGGGAGUCGCUGACGGGCACGC… 1791 nt 0.5734
NM_001127205.2 NCBI
AUUGUCCACUAAGGUCUGGCAGGUCUGAUUGCCUCUUUUCAGGCACUGA… 1753 nt 0.5562
NM_001127206.3 NCBI
AGUUAGACCAAAAUGAGCGAGGUGGAGAGCCUCUUAACCGGAUGCUACG… 1695 nt 0.5540
NM_001286267.2 NCBI
GCUGGGCUGCAGGGACUGCGGCGCCUGAGGGAGUCGCUGACGGGCACGC… 1794 nt 0.5708
NM_001286268.2 NCBI
GCUGGGCUGCAGGGACUGCGGCGCCUGAGGGAGUCGCUGACGGGCACGC… 1851 nt 0.5900
NM_001286269.2 NCBI
GCUGGGCUGCAGGGACUGCGGCGCCUGAGGGAGUCGCUGACGGGCACGC… 1772 nt 0.5632
NM_001286270.2 NCBI
AUUGUCCACUAAGGUCUGGCAGGUCUGAUUGCCUCUUUUCAGGCACUGA… 2090 nt 0.5574
NM_001286271.2 NCBI
GCUGGGCUGCAGGGACUGCGGCGCCUGAGGGAGUCGCUGACGGGCACGC… 1546 nt 0.5750
NM_002134.4 NCBI
GCUGGGCUGCAGGGACUGCGGCGCCUGAGGGAGUCGCUGACGGGCACGC… 1673 nt 0.5714
Summary

Heme oxygenase, an essential enzyme in heme catabolism, cleaves heme to form biliverdin, which is subsequently converted to bilirubin by biliverdin reductase, and carbon monoxide, a putative neurotransmitter. Heme oxygenase activity is induced by its substrate heme and by various nonheme substances. Heme oxygenase occurs as 2 isozymes, an inducible heme oxygenase-1 and a constitutive heme oxygenase-2. HMOX1 and HMOX2 belong to the heme oxygenase family. Several alternatively spliced transcript variants encoding three different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2013]

Forensic Context

A study in Tibetan and Bama pigs (Sus scrofa domesticus) demonstrated that the HMOX2 was uniquely upregulated in the skeletal muscle of cold-exposed Tibetan pigs, indicating a role in the cold adaptation response [Yang et al. DOI:10.3390/ijms24087431]. In human trauma patients, major blunt force injury triggered a selective upregulation of the HMOX2 in circulating leukocytes, and its expression level was significantly correlated with clinical Max Denver 2 trauma scores [Brandfellner et al. DOI:10.1097/SHK.0b013e31829de02f].