Basic Information

Symbol
HNRNPA0
RNA class
mRNA
Alias
Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein A0 HNRPA0 HnRNP A0 HnRNA Binding Protein
Location (GRCh38)
5:137745651-137754363
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006805.4
Sequence length
8713.0 nt
GC content
0.4102

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2569.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2735.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2567.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006805.4 NCBI
CUCUUUGUGUGGUGCCCAGAUAGGGGAGCGGAGGUGGCGGCGGCGGCGG… 8713 nt 0.4102
Summary

This gene belongs to the A/B subfamily of ubiquitously expressed heterogeneous nuclear ribonucleoproteins (hnRNPs). The hnRNPs are RNA binding proteins and they complex with heterogeneous nuclear RNA ( hnRNA ). These proteins are associated with pre-mRNAs in the nucleus and appear to influence pre-mRNA processing and other aspects of mRNA metabolism and transport. While all of the hnRNPs are present in the nucleus, some seem to shuttle between the nucleus and the cytoplasm. The hnRNP proteins have distinct nucleic acid binding properties. The protein encoded by this gene has two repeats of quasi-RRM domains that bind RNAs, followed by a glycine-rich C-terminus. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.