Basic Information

Symbol
AMOT
RNA class
mRNA
Alias
Angiomotin KIAA1071
Location (GRCh38)
X:112774503-112840831
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001113490.2
Sequence length
7613.0 nt
GC content
0.4764

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2449.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2585.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1785.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001113490.2 NCBI
ACCUCCCAUCCUUUGCCCAGGAGCUGCCUUGGCAGUCACGCCCCUUCCU… 7613 nt 0.4764
NM_001386998.1 NCBI
ACCUCCCAUCCUUUGCCCAGGAGCUGCCUUGGCAGUCACGCCCCUUCCU… 7687 nt 0.4765
NM_001386999.1 NCBI
ACCUCCCAUCCUUUGCCCAGGAGCUGCCUUGGCAGUCACGCCCCUUCCU… 7823 nt 0.4781
NM_133265.5 NCBI
ACCUCCCAUCCUUUGCCCAGGAGCUGCCUUGGCAGUCACGCCCCUUCCU… 6530 nt 0.4663
Summary

This gene belongs to the motin family of angiostatin binding proteins characterized by conserved coiled-coil domains and C-terminal PDZ binding motifs. The encoded protein is expressed predominantly in endothelial cells of capillaries as well as larger vessels of the placenta where it may mediate the inhibitory effect of angiostatin on tube formation and the migration of endothelial cells toward growth factors during the formation of new blood vessels. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice and human heart samples demonstrated that the AMOT is a potential alternative upstream regulator of the Hippo pathway, which is causally activated in arrhythmogenic cardiomyopathy [Chen et al. DOI:10.1161/CIRCRESAHA.114.302810].