Basic Information

Symbol
HOXB7
RNA class
mRNA
Alias
Homeobox B7 HOX2C Homeobox Protein Hox-B7 Homeobox Protein HHO.C1 Homeobox Protein Hox-2C Homeo Box B7 HOX2 Homeo Box C1 Protein Homeo Box 2C Hox-2.3 HHO.C1
Location (GRCh38)
17:48607232-48633572
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004502.4
Sequence length
1363.0 nt
GC content
0.5077

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-437.42 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -465.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 349.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004502.4 NCBI
CUUUUUGGUGUAAAUCUGGACUCUAAUUCUGUAAUAUAUCAAGGAAUCU… 1363 nt 0.5077
Summary

This gene is a member of the Antp homeobox family and encodes a protein with a homeobox DNA-binding domain. It is included in a cluster of homeobox B genes located on chromosome 17. The encoded nuclear protein functions as a sequence-specific transcription factor that is involved in cell proliferation and differentiation. Increased expression of this gene is associated with some cases of melanoma and ovarian carcinoma. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the HOXB7 gene, a homeobox protein, was significantly upregulated in fetal cardiac fibroblasts compared to neonatal cells and was core-enriched in developmental gene sets, indicating its role in age-dependent transcriptional programming during cardiac development [Perreault et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00074.2021].