Basic Information

Symbol
HOXC13
RNA class
mRNA
Alias
Homeobox C13 HOX3G Homeobox Protein Hox-C13 Homeobox Protein Hox-3G HOX3 Homeo Box C13 NUP98/HOXC13 Homeo Box 3G ECTD9
Location (GRCh38)
12:53938831-53946544
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017410.3
Sequence length
2357.0 nt
GC content
0.5745

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-894.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -933.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 856.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_017410.3 NCBI
AAACAGGAGCGAGGUGUCUCCCUAGCUCGCUGCCUCUGGCAAGUGGAGU… 2357 nt 0.5745
Summary

This gene belongs to the homeobox family of genes. The homeobox genes encode a highly conserved family of transcription factors that play an important role in morphogenesis in all multicellular organisms. Mammals possess four similar homeobox gene clusters, HOXA, HOXB, HOXC and HOXD, which are located on different chromosomes and consist of 9 to 11 genes arranged in tandem. This gene is one of several homeobox HOXC genes located in a cluster on chromosome 12. The product of this gene may play a role in the development of hair, nail, and filiform papilla. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.