Basic Information
Symbol
HPR
RNA class
mRNA
Alias
Haptoglobin-Related Protein
Haptoglobin-Related Locus
A-259H10.2
HP
Location (GRCh38)
16:72063148-72077246
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_020995.4
Sequence length
1242.0 nt
GC content
0.4992
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-395.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-417.59 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
475.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| ACUGCUCUUCCAGAGGCAAGACCAACCAAGAUGAGCACCGAGCAUUUGU… | 1479 nt | 0.5003 | |
| ACUGCUCUUCCAGAGGCAAGACCAACCAAGAUGAGUGACCUGGGAGCUG… | 1242 nt | 0.4992 |
Summary
This gene encodes a haptoglobin-related protein that binds hemoglobin as efficiently as haptoglobin. Unlike haptoglobin, plasma concentration of this protein is unaffected in patients with sickle cell anemia and extensive intravascular hemolysis, suggesting a difference in binding between haptoglobin-hemoglobin and haptoglobin-related protein-hemoglobin complexes to CD163, the hemoglobin scavenger receptor. This protein may also be a clinically important predictor of recurrence of breast cancer. [provided by RefSeq, Oct 2011]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.