Basic Information

Symbol
HRH1
RNA class
mRNA
Alias
Histamine Receptor H1 Histamine H1 Receptor H1-R HH1R H1R Histamine Receptor, Subclass H1 HisH1
Location (GRCh38)
3:11137093-11263557
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001098212.2
Sequence length
4617.0 nt
GC content
0.4672

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1487.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1568.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1543.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000861.3 NCBI
AGUAUUGGAGUGUUACAGGGAGACAUACAGGAUUUAAGAAGCCCAUCAU… 4427 nt 0.4556
NM_001098211.2 NCBI
GUAAAGAACUAACUGAAUGUCUUGCCAGGGUAAGAGGAUGAGAACAGGC… 4634 nt 0.4633
NM_001098212.2 NCBI
ACACCCAGCAGCCUGGCCGCCGCGGCCAACGCGCCACCAAACUUUCCCC… 4617 nt 0.4672
NM_001098213.2 NCBI
GCAUUUUCUUUUGAUAGUAGCCGUAGAGAAGUUGUCCGCCAGGCAGCCC… 4717 nt 0.4632
Summary

Histamine is a ubiquitous messenger molecule released from mast cells, enterochromaffin-like cells, and neurons. Its various actions are mediated by histamine receptors H1, H2, H3 and H4. The protein encoded by this gene is an integral membrane protein and belongs to the G protein-coupled receptor superfamily. It mediates the contraction of smooth muscles, the increase in capillary permeability due to contraction of terminal venules, the release of catecholamine from adrenal medulla, and neurotransmission in the central nervous system. It has been associated with multiple processes, including memory and learning, circadian rhythm, and thermoregulation. It is also known to contribute to the pathophysiology of allergic diseases such as atopic dermatitis, asthma, anaphylaxis and allergic rhinitis. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Jan 2015]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that histamine receptor H1 (HRH1) is one of the histamine receptor types identified in the brain [Shimada et al. DOI:10.1016/j.jocn.2011.06.033]. Research in human patients with head trauma found that HRH1 mRNA expression was significantly upregulated in the salivary extracellular vesicles of concussion clinic patients compared to healthy participants and was higher in these patients than in emergency department patients with acute injury [Cheng et al. DOI:10.4103/1673-5374.266924].