Basic Information

Symbol
HS3ST4
RNA class
mRNA
Alias
Heparan Sulfate-Glucosamine 3-Sulfotransferase 4 3OST4 Heparan Sulfate D-Glucosaminyl 3-O-Sulfotransferase 4 Heparan Sulfate (Glucosamine) 3-O-Sulfotransferase 4 Heparan Sulfate Glucosamine 3-O-Sulfotransferase 4 Heparan Sulfate 3-O-Sulfotransferase 4 H3-OST-4 3-OST-4 EC 2.8.2.23 EC 2.8.2 30ST4
Location (GRCh38)
16:25691959-26137685
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006040.3
Sequence length
3267.0 nt
GC content
0.5886

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1362.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1418.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 900.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006040.3 NCBI
CUCCCCUCCGCGCCUCUCCUCUCUCCCGGCAGAAAGUUAGCAGCGGGGA… 3267 nt 0.5886
Summary

This gene encodes the enzyme heparan sulfate D-glucosaminyl 3-O-sulfotransferase 4. This enzyme generates 3-O-sulfated glucosaminyl residues in heparan sulfate. Cell surface heparan sulfate is used as a receptor by herpes simplex virus type 1 (HSV-1), and expression of this gene is thought to play a role in HSV-1 pathogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.