Basic Information

Symbol
HSD17B12
RNA class
mRNA
Alias
Hydroxysteroid 17-Beta Dehydrogenase 12 SDR12C1 KAR 3-Ketoacyl-CoA Reductase Short Chain Dehydrogenase/Reductase Family 12C Member 1 Very-Long-Chain 3-Oxoacyl-CoA Reductase 17-Beta-Hydroxysteroid Dehydrogenase 12 Estradiol 17-Beta-Dehydrogenase 12 17-Beta-HSD 12 Short Chain Dehydrogenase/Reductase Family 12C, Member 1 Hydroxysteroid (17-Beta) Dehydrogenase 12 Steroid Dehydrogenase Homolog 17beta-HSD Type 12 EC 1.1.1.330 EC 1.1.1.62
Location (GRCh38)
11:43680509-43857741
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016142.3
Sequence length
2396.0 nt
GC content
0.3848

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-605.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -653.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 618.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_016142.3 NCBI
GUCAUCCUCACCGUCACGGCCGGCGCCUCCUCCUGGAUUCAUUCACUCG… 2396 nt 0.3848
Summary

This gene encodes a very important 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase (17beta-HSD) that converts estrone into estradiol in ovarian tissue. This enzyme is also involved in fatty acid elongation. [provided by RefSeq, Oct 2011]

Forensic Context

A study in healthy young women demonstrated that mRNA expression of the HSD17B12 in whole adipose tissue was lower in heavier co-twins compared to their leaner counterparts and correlated inversely with percent body fat and subcutaneous fat [Vihma et al. DOI:10.1016/j.steroids.2018.08.006]. In irradiated skin tissues from mice and rats, the HSD17B12 gene was upregulated and identified as a key fatty acid-associated gene involved in fatty acid metabolism, biosynthesis of unsaturated fatty acids, and fatty acid elongation [Tu et al. DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.01.001].